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日光東照宮 1985年離脱(←←←政治活動には熱心)
明治神宮 2004年離脱（2010年に復帰）
気多神社 2010年離脱
梨木神社 2013年離脱
富岡八幡宮 2017年離脱
この様に離脱が止まらない理由については複数の書籍にてさまざまな見解がなされている。
一つは神社本庁が官僚的すぎて地方の社殿の困窮に無頓着であること。
また、地域における大社が、給与などの待遇面においては神社本庁より上である事例も複数あることから、
絶好の転職先ポストとして利用している側面、
またその際の口実として地域の押した女性の宮司の着任を認めなかったり排除する事例が
多々発生していることなどによる騒動の末に次々と離脱している。
詳しくは各自ネットでチェック
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今回は、本庁以外の神社神道系の包括団体について記させていただきます。
①神社本庁
②神社本教 … 近畿の府県（大半は京都市内）に分布する神社８０社を包括。
信者数は不明。事務局の所在地は京都府京都市東山区。神社本教についての詳細は別項で後述します。
③神社産土教 … 広島県下の神社を中心に７２神社と２布教所を包括。
信者数は90,000人。事務局の所在地は広島県三原市。
④北海道神社協会 … かつて大日本神祇会北海道支部渡島部会に属していた神社６１社を包括。
信者数は69,000人。事務局の所在地は北海道北斗市。北海道神社協会についての詳細は別項で後述します。
⑤木曽御嶽本教 … ２７５教会とその他の１１団体を包括。信者数は人46,984。
事務局の所在地は長野県木曽町。
⑥神道石切教 … ３神社とその他の９団体を包括。信者数は16,799人。事務局の所在地は大阪府東大阪市。
⑦神宮教 … １神社のみ包括。信者数は1,000人。事務局の所在地は兵庫県篠山市。
⑧誠心明生会 … 包括団体の数は不明。信者数は２０人と記されているので実質不活動状態にあると思われます。
事務局の所在地は広島県福山市。
⑨出雲日御碕大神宮教 … ２教会と４布教所を包括。信者数は2,110人。事務局の所在地は島根県出雲市。
⑩出雲神奈備教 … １神社と１教会を包括。信者数は800人。事務局の所在地は島根県出雲市。
⑪石鎚本教 … ８２教会と８３布教所を包括。信者数は96,943人。
事務局の所在地は愛媛県西条市。
⑫出雲教 … １神社と８教会を包括。信者数は94,933人。
事務局の所在地は島根県出雲市。
⑬日本神宮本庁 … ２４神社と２８布教所を包括。信者数は13,211人。
事務局の所在地は北海道帯広市。
⑭日本神社教団 … １４神社を包括。信者数は1,050人。
事務局の所在地は茨城県八千代町。
⑮大和教 … ３教会を包括。信者数は1,926人。
事務局の所在地は宮城県塩釜市。