【R言語】統計解析フリーソフトR 第4章【GNU R】at MATH
【R言語】統計解析フリーソフトR 第4章【GNU R】 - 暇つぶし2ch492:132人目の素数さん
12/04/28 23:15:54.50
放送大学 授業科目案内 データからの知識発見('12)

URLリンク(www.ouj.ac.jp)
これかな
これぐらいの内容をざっと教えているのはいいね

493:132人目の素数さん
12/04/29 11:21:12.19
binary <- c(T,F)
binaries <- data.frame("1st"=binary)
cbind(binaries,"2nd"=binary,"3rd"=binary)

X1st 2nd 3rd
1 TRUE TRUE TRUE
2 FALSE FALSE FALSE

このデータの順列すべてつまり2^3個分を表示したいのですが、
どうすればいいですか。
TRUE,TRUE,TRUE
TRUE,TRUE,FALSE
TRUE,FALSE,TRUE
TRUE,FALSE,FALSE
こんな風にです

494:132人目の素数さん
12/04/29 15:04:56.43
>>493

library(gtools)
permutations(2, 3, c(T, F), repeats.allowed=TRUE)[8:1,]


495:132人目の素数さん
12/04/30 00:13:16.11
>>494
ありがとうございます!まさにそれです。
permutation、ずばり順列そのもののコマンドがあるのですか。
勉強になりました。

496:132人目の素数さん
12/05/03 20:30:15.24
          __ノ)-'´ ̄ ̄`ー- 、_
        , '´  _. -‐'''"二ニニ=-`ヽ、
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     |   |  | / / レ',二、レ′ ,ィイ|゙/   私は只の数ヲタなんかとは付き合わないわ。
.     |   \ ∠イ  ,イイ|    ,`-' |      頭が良くて数学が出来てかっこいい人。それが必要条件よ。
     |     l^,人|  ` `-'     ゝ  |        さらに Ann.of Math に論文書けば十分条件にもなるわよ。
      |      ` -'\       ー'  人          一番嫌いなのは論文数を増やすためにくだらない論文を書いて
    |        /(l     __/  ヽ、           良い論文の出版を遅らせるお馬鹿な人。
     |       (:::::`‐-、__  |::::`、     ヒニニヽ、         あなたの論文が Ann of Math に accept される確率は?
    |      / `‐-、::::::::::`‐-、::::\   /,ニニ、\            それとも最近は Inv. Math. の方が上かしら?
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497:132人目の素数さん
12/05/05 22:45:04.63
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498:132人目の素数さん
12/05/06 13:20:53.64
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499:132人目の素数さん
12/05/06 16:50:58.01
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500:132人目の素数さん
12/05/08 14:04:54.27
RMeCabこんな感じに文字化けしちゃう

========================
險伜捷
"私は彼女のこ\x82"
========================


SetLocaleしてみた
============================
> Sys.getlocale
LC_COLLATE=Japanese_Japan.932;LC_CTYPE=Japanese_Japan.932;LC_MONETARY=Japanese_Japan.932;LC_NUMERIC=C;LC_TIME=Japanese_Japan.932"

> Sys.setlocale("LC_CTYPE","ja_JP.UTF-8")
警告メッセージ:
In Sys.setlocale("LC_CTYPE", "ja_JP.UTF-8") :
ロケールを "ja_JP.UTF-8" に設定せよとのOS のレポート要求は受け入れられません
==================================

なんかUTF-8に変えられないんだよね
環境はWin7/64bitです

だれか解決策教えて下さいな

501:132人目の素数さん
12/05/08 14:06:53.60
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502:132人目の素数さん
12/05/08 14:07:16.16
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503:132人目の素数さん
12/05/08 14:32:23.18
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504:132人目の素数さん
12/05/08 19:17:29.11
>>500
Rとは関係なしにMeCabが使える状態なのかどうかは確認した?
RMeCabはRの中からMeCabをただ単にcallしているだけなので、
そもそもMeCabが使えなかったら、RMeCabも使えない。

505:132人目の素数さん
12/05/08 19:44:31.59
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506:132人目の素数さん
12/05/09 12:16:57.42
>>504
コマンドプロンプト上からMeCab自体はつかえてるっぽいけど文字化けしてる
===============================
> 私は只の数ヲタなんかとは付き合わないわ。
私は只の数ヲ 險伜捷,荳€闊ャ,*,*,*,*,*
^ 蜷崎ゥ・繧オ螟画磁邯・*,*,*,*,*
險伜捷,荳€闊ャ,*,*,*,*,*
ネ 蜷崎ゥ・蝗コ譛牙錐隧・邨・ケ・*,*,*,*
ゥ 險伜捷,荳€闊ャ,*,*,*,*,*
ニ 蜷崎ゥ・蝗コ譛牙錐隧・邨・ケ・*,*,*,*
ヘ 險伜捷,荳€闊ャ,*,*,*,*,*
t 蜷崎ゥ・蝗コ譛牙錐隧・邨・ケ・*,*,*,*
き合わないわ。 險伜捷,荳€闊ャ,*,*,*,*,*
============================

CMDの文字コードがShift-JISで、MeCabがutf-8版だから
こうなるのはわかるんだけど
============================
932 (ANSI/OEM - 日本語 Shift-JIS)
============================


507:132人目の素数さん
12/05/09 13:04:31.70
>>506
Windowsのことはよくわからないけど、
コマンドプロンプトをuft-8になんとかして変更するとか(utf-8な代替ソフトを使うとか)、
MeCabに喰わせる前後で、nkfをかましてUTF-8/CP932の変換を行うとか、
MeCabを使うときだけ、文字化けしない環境(MacOSXやLinux)を使うとか、
真に解決しなければならないものなら、試す価値のある方法はたくさんありそうだ。

あと、SDOUTで文字化けするなら、ファイルにリダイレクトして、
UTF-8を扱えるテキストエディタで開くと文字化けしないのかどうかチェックすることも必要では?

508:132人目の素数さん
12/05/09 14:15:31.27
>>507
標準出力して、utf8形式でエディタ(TeraPad)にファイルを読み込んでみたら
なんと一部の文字列が文字化けしてました。MeCabの出力がutf-8ではないのか?
==========================
> echo "頭が良くて数学が出来てかっこいい人。それが必要条件よ。 " | mecab > out.txt
==========================

Terapadでout.txtをutf-8形式で読み込んでみた
===========================
" 名詞,サ変接続,*,*,*,*,*
?a?a? 記号,一般,*,*,*,*,*
? 名詞,固有名詞,組織,*,*,*,*
-? 記号,一般,*,*,*,*,*
? 名詞,固有名詞,組織,*,*,*,*
?? 記号,一般,*,*,*,*,*
w 名詞,固有名詞,組織,*,*,*,*
?a? 記号,一般,*,*,*,*,*
- 略 -
EOS
=========================
Terapadで対応している他のコード(Shift-JIS,JIS,EUC,Unicode)でも
読み込んでみましたが、Utf-8以外だと文字化けしまくってました。

Win7のコマンドプロンプトをutf-8に変更するのは、たしかレジストリを弄る必要あったな
URLリンク(sgry.jp)
あとでやってみます

nkfをかませる方法だとRMeCabのソースに書き加えて再ビルドするかんじですか?
それともR側にそういうオプションがあったりします?

509:132人目の素数さん
12/05/09 14:37:47.21
(続き)
>>507
さっきの文字化けの原因、わかりました。
"頭が良くて数学が~"の文字列がCP932なのにMeCabに読み込ませていたからでした。
CMDをutf-8にしてもう一度出力してエディタで開いてみたところ
========================
" 名詞,サ変接続,*,*,*,*,*
頭 名詞,一般,*,*,*,*,頭,アタマ,アタマ
が 助詞,格助詞,一般,*,*,*,が,ガ,ガ
良く 形容詞,自立,*,*,形容詞・アウオ段,連用テ接続,良い,ヨク,ヨク
て 助詞,接続助詞,*,*,*,*,て,テ,テ
数学 名詞,一般,*,*,*,*,数学,スウガク,スーガク
が 助詞,格助詞,一般,*,*,*,が,ガ,ガ
出来 動詞,自立,*,*,一段,連用形,出来る,デキ,デキ
- 略 -
EOS
=========================
正常に表示されました。やったね。

つぎはRとMeCabのオプション調べてみます。
作業はなるべくWin7で完結させたいです。

510:132人目の素数さん
12/05/09 15:36:01.63
          __ノ)-'´ ̄ ̄`ー- 、_
        , '´  _. -‐'''"二ニニ=-`ヽ、
      /   /:::::; -‐''"        `ーノ
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      |   |/ / / /| ,ハノ| /|ノレ,ニ|ル' 
     |   |  | / / レ',二、レ′ ,ィイ|゙/   私は只の数ヲタなんかとは付き合わないわ。
.     |   \ ∠イ  ,イイ|    ,`-' |      頭が良くて数学が出来てかっこいい人。それが必要条件よ。
     |     l^,人|  ` `-'     ゝ  |        さらに Ann.of Math に論文書けば十分条件にもなるわよ。
      |      ` -'\       ー'  人          一番嫌いなのは論文数を増やすためにくだらない論文を書いて
    |        /(l     __/  ヽ、           良い論文の出版を遅らせるお馬鹿な人。
     |       (:::::`‐-、__  |::::`、     ヒニニヽ、         あなたの論文が Ann of Math に accept される確率は?
    |      / `‐-、::::::::::`‐-、::::\   /,ニニ、\            それとも最近は Inv. Math. の方が上かしら?
   |      |::::::::::::::::::|` -、:::::::,ヘ ̄|'、  ヒニ二、 \
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511:132人目の素数さん
12/05/09 20:12:11.20
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512:132人目の素数さん
12/05/09 21:04:27.28
>>500
基底

513:132人目の素数さん
12/05/18 01:25:32.37
b <- rbind(1:2)
c <- cbind(1:2)
b+c
このような感じで
2 3
3 4
こういう結果を出すような方法はありますか?
このまま実行したら
>以下にエラー b + c : 適切な配列ではありません
と出ました

514:132人目の素数さん
12/05/18 05:42:13.21
cbind(c,c) + rbind(b,b)

515:132人目の素数さん
12/05/18 13:45:22.19
>>514
ちょっ、b, cは最高に単純化した例だろw

> outer(b,c,"+")
, , 1, 1

[,1] [,2]
[1,] 2 3

, , 2, 1

[,1] [,2]
[1,] 3 4
となるけど、
> d1 <- 1:2
> d2 <- 1:2
> outer(d1,d2,"+")
[,1] [,2]
[1,] 2 3
[2,] 3 4
となることからヒントを得ると、次のようにすればよい。
> outer(as.vector(b),as.vector(c),"+")
[,1] [,2]
[1,] 2 3
[2,] 3 4

516:132人目の素数さん
12/05/18 18:05:46.17
Rjpwikiに回答したくないので(スルー検定失格の烙印を押されたくないので)、こちらに書く。

> line <- '127.0.0.1 - frank [10/Oct/2000:13:55:36 -0700] "GET /apache_pb.gif HTTP/1.0" 200 2326 "hURLリンク(www.example.com)" "Mozilla/4.08 [en] (Win98; I ;Nav)" '
> m <- gregexpr("(\\d|[01]?\\d\\d|2[0-4]\\d|25[0-5])\\.(\\d|[01]?\\d\\d|2[0-4]\\d|25[0-5])\\.(\\d|[1]?\\d\\d|2[0-4]\\d|25[0-5])\\.(\\d|[01]?\\d\\d|2[0-4]\\d|25[0-5]) ", line, perl=TRUE)
> regmatches(line, m)
[[1]]
[1] "127.0.0.1 "

正規表現が書けるという前提だけど、上に示すとおり格段に難しいわけではない。
従って「非常に面倒かどうか」に対する答えは「全く面倒ではありません。ほぼコピペの世界です。」だ。


517:132人目の素数さん
12/05/19 00:29:19.34
>>514-515
ありがとうございます。>>515がまさに望んでいたものでした。
outer関数についてよく勉強します。

518:132人目の素数さん
12/05/19 08:44:41.03
a1 <- c("a", "b", "d", "f")
a2 <- c("b", "a", "f", "c")
a3 <- c("z", "m", "f", "a")
cbind(a1,a2,a3)
それぞれの行で"a"がある回数を求め、
処理結果をベクター、この場合にはc(1,1,0,1)としてまとめるにはどうすればよいでしょうか

519:132人目の素数さん
12/05/19 09:22:50.09
>>518
ヒントを差し上げるので自力で考えてください。

> length(grep("a",c("b", "c", "d", "f")))
[1] 0
> length(grep("a",c("a", "b", "d", "f")))
[1] 1
> length(grep("a",c("a", "a", "d", "f")))
[1] 2

行単位で処理を繰り返す関数はapply()


520:132人目の素数さん
12/05/19 15:06:19.07
# apply()を使わない手を考えようとしたが無理だった。

a1 <- c("a","b","d","f")
a2 <- c("b","a","f","c")
a3 <- c("z","m","f","a")
dat <- cbind(a1,a2,a3)
dat
dat == "a"

margin.table(dat == "a", margin = 1)

apply(dat == "a", MARGIN = 1, FUN = sum)


521:132人目の素数さん
12/05/19 15:15:20.42
>>520
おぉ、それなら、
> rowSums(dat == "a")
[1] 1 1 0 1
もうこれでよさそう。

もう少し大きなテーブルでやってみると、
> d <- cbind(sample(letters[1:5],100,replace=TRUE),sample(letters[1:5],100,replace=TRUE),sample(letters[1:5],100,replace=TRUE))
> rowSums(d == "a")
[1] 1 1 0 0 1 0 0 1 0 0 2 0 1 0 2 0 0 1 2 0 0 0 1 0 1 1 1 1 1 1 3 1 1 2 0 1 1
[38] 0 2 0 2 1 0 0 1 1 1 0 1 1 1 0 0 0 0 0 0 1 0 1 0 0 1 0 0 0 2 0 2 0 0 1 0 0
[75] 0 0 1 0 1 1 0 0 1 1 1 1 1 0 0 1 1 0 0 0 0 0 2 0 1 0
大丈夫そうだ。

# ヒントだけのつもりだったのに。。。

522:132人目の素数さん
12/05/19 16:52:03.11
>>521
その手があったか。

速度的には
rowSum()
が有利と思われる。

523:132人目の素数さん
12/05/19 20:49:13.27
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524:132人目の素数さん
12/05/19 23:04:29.94
>>519-522
みなさんありがとうございます。
applyとrowsum()の両方を使えるようにします。


525:132人目の素数さん
12/05/20 00:05:52.54
>>524
rowSums() だった。大文字小文字を区別するので注意。

URLリンク(entertainment-lab.blogspot.jp)


526:132人目の素数さん
12/05/23 06:06:44.69
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527:132人目の素数さん
12/05/23 08:15:18.64
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528:132人目の素数さん
12/05/24 21:30:30.29
すいません、ほんっとに初歩的な質問なんですが…
Wikiをざっと見ても行列Tipsを検索しても見当たらないので質問させてください

データフレームを数値行列に変換させるにはどうすればよいのでしょうか?
列成分をデータフレームから指定しても、as.matrixなどの変換をしても、
%*%の操作をすると数値行列にしてくださいと言われます

とりあえずデータフレームの数値を使って行列計算をしたいので、誰かサクッと教えていただけると助かりますm(_ _)
m

529:132人目の素数さん
12/05/25 01:12:42.02
as.matrixの前後でstr()してみて。
多分factorになっていて数字ではないのではないかと思う。

530:132人目の素数さん
12/05/25 03:03:02.18
そうでした
そしてこれを数字にするには…

531:132人目の素数さん
12/05/25 03:04:41.50
as.characterしてas.numericで数値化されるかどうか

532:132人目の素数さん
12/05/25 09:13:25.21
>>531
ヘルプには
To transform a factor ‘f’ to
approximately its original numeric values,
as.numeric(levels(f))[f]’ is recommended and slightly more
efficient than ‘as.numeric(as.character(f))’.
て書いてあるけどね。

533:132人目の素数さん
12/05/25 15:01:44.54
>>532
そんなやり方があるのか、覚えられないなでも

534:132人目の素数さん
12/05/25 16:48:14.73
>>533
今、確認してみたら、as.numeric()だけでも元に数字に戻るね。
> (a <- factor(sample(1:5, 10, replace = TRUE)))
[1] 2 3 1 1 1 1 1 5 2 2
Levels: 1 2 3 5
> as.numeric(a)
[1] 2 3 1 1 1 1 1 4 2 2
> as.numeric(levels(a))[a]
[1] 2 3 1 1 1 1 1 5 2 2
> as.numeric(as.character(a))
[1] 2 3 1 1 1 1 1 5 2 2

前からこうだったっけ?
いつの間にか仕様が変わった?


535:532, 534
12/05/25 16:50:52.24
あっ、ごめん。たまたまsample()の出力がわかりにくかっただけみたいだ。
as.numeric()だと「5」のところが「4」になっているから、
as.numeric(factorクラス)はやっぱり駄目だ。

536:132人目の素数さん
12/05/25 16:54:11.34
もっと顕著に分かるようにしてみた。スレ汚しすまん。
> (a <- factor(sample(1:100, 10)))
[1] 24 42 40 33 66 51 20 100 91 26
Levels: 20 24 26 33 40 42 51 66 91 100
> as.numeric(a)
[1] 2 6 5 4 8 7 1 10 9 3
> as.numeric(as.character(a))
[1] 24 42 40 33 66 51 20 100 91 26
> as.numeric(levels(a))[a]
[1] 24 42 40 33 66 51 20 100 91 26


537:132人目の素数さん
12/05/27 07:33:26.16
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      |      ` -'\       ー'  人          一番嫌いなのは論文数を増やすためにくだらない論文を書いて
    |        /(l     __/  ヽ、           良い論文の出版を遅らせるお馬鹿な人。
     |       (:::::`‐-、__  |::::`、     ヒニニヽ、         あなたの論文が Ann of Math に accept される確率は?
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538:132人目の素数さん
12/05/27 08:50:40.45
>>536

ご丁寧にどうもです!
as.numericだと変な数字になるから悩んでたのですが、そういう方法もあったのですね
as.matrixだけでも計算できない場合でもこれでよさそうです

ありがとうございました

539:132人目の素数さん
12/05/29 04:32:41.65
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540:132人目の素数さん
12/06/03 20:40:13.33
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541:132人目の素数さん
12/06/03 23:20:55.48
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542:132人目の素数さん
12/06/04 00:09:13.82
pattern <- c("ab","ef")
target <- c("abaa","abef","aefe","cafe")

のように、2個のベクトルがあるとき、
pattern の各要素が target の各要素に含まれるかどうかを検索したい。
for 文を使わずに済ます、何かいい方法ある?

例えば上の例では、
[1] "abaa" "abef" "aefe"
のように出力されたら OK です。

つまり、コマンドライン的なら
grep -f pattern target
のようなことを R を使ってやりたいわけです。


543:132人目の素数さん
12/06/04 01:07:52.08
>>542
?grepで意味が分からないなら
もうsystem()でいいじゃん

544:132人目の素数さん
12/06/04 07:28:20.53
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545:132人目の素数さん
12/06/04 09:11:46.10
>>543
grep() は、pattern の vector 長が 2 以上の場合、最初の要素しか
使われないのです。その上、target 内の要素の位置をベクトルで返す仕様。
せめて、論理値をベクトルで返してくれたらね。

残念なことに R を動かす環境には grep コマンドがなく、
現在は unix 環境で前処理してるけど、面倒臭いなあと思って
良い方法がないか尋ねた次第です。


546:132人目の素数さん
12/06/04 09:16:32.70
あ、grepl は、論理値ベクトルを返してくれるんだね。知らなかったわ。


547:543
12/06/04 09:31:57.61
grep関数群のヘルプを読んだ上で質問していたのか。
なら、下記はどうだろう?
> target[unique(as.numeric(sapply(1:length(pattern), function(i){grep(pattern[i], target)})))]
[1] "abaa" "abef" "aefe"

で、関数化すれば
> f542 <- function(x, y) {target[unique(as.numeric(sapply(1:length(x), function(i){grep(x[i], y)})))]}
> f542(pattern, target)
[1] "abaa" "abef" "aefe"
となる。

apply関数群もなしにすましたいという後出しは禁止。

548:543
12/06/04 09:38:53.74
おぉ、凡ミス

f542 <- function(x, y) {target[unique(as.numeric(sapply(1:length(x), function(i){grep(x[i], y)})))]}

f542 <- function(x, y) {y[unique(as.numeric(sapply(1:length(x), function(i){grep(x[i], y)})))]}

549:542
12/06/04 10:34:25.66
>>548
なるほど。確かに目的の処理ができます。
どうもありがとう。
私の頭がforで、applyできていませんでした。


550:132人目の素数さん
12/06/04 12:34:01.89
          __ノ)-'´ ̄ ̄`ー- 、_
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551:132人目の素数さん
12/06/04 19:03:37.28
頭の体操
> target[unique(c(sapply(pattern, function(x) grep(x, target))))]
[1] "abaa" "abef" "aefe"



552:551
12/06/04 19:07:14.04
こっちのほうがいいかも
> unique(c(sapply(pattern, function(x) grep(x, target, value=TRUE))))
[1] "abaa" "abef" "aefe"



553:542
12/06/04 19:39:49.43
>>552 は、target内の要素が相異なることが前提になりますね。

あとは、target内の要素の順序を保つようにならないものかな。


554:542
12/06/04 19:47:57.32
まあ、ソートすればOKと。

pattern <- c("ab","ef"); target <- c("abaa","abef","aefe","cafe","abef")

target[sort(unique(c(sapply(pattern, function(x) grep(x, target)))))]


555:132人目の素数さん
12/06/04 19:49:05.43
>>551, 552
あぁ、そうだね。
わざわざ1:lenght(pattern)でやるより、簡潔にsapply(pattern, function(x) ...)でよかった。
ご指摘ありがとう。

> target <- apply(matrix(sample(letters[1:6], 4 * 10000, replace = TRUE), ncol = 4), 1, paste, collapse = '')
> pattern <- c("ab","ef")

> system.time(target[unique(unlist(sapply(1:length(pattern), function(i){grep(pattern[i], target)})))])
ユーザ システム 経過
0.004 0.000 0.005
> system.time(unique(c(sapply(pattern, function(x) grep(x, target, value=TRUE)))))
ユーザ システム 経過
0.004 0.000 0.007

速度的にはあまり変わらないみたいだが。


556:542
12/06/04 21:20:11.29
ミスがありました。>>553 は unlist しないと駄目でした。
target[sort(unique(unlist(sapply(pattern, function(x) grep(x, target)))))]

あと、greplを使えないかなと思い、>>555 氏の方法でランダム生成した
サイズ 10000 の target に対し、
target[apply(sapply(pattern,function(x)grepl(x,target)),1,any)]
を適用してみましたが、apply系の関数を2重に使うと、当たり前ですが
遅くなりますね。
> pattern <- c("ab","ef")
> target <- apply(matrix(sample(letters[1:6], 4 * 10000, replace = TRUE), ncol = 4), 1, paste, collapse = '')
> system.time(target[unique(unlist(sapply(1:length(pattern), function(i){grep(pattern[i], target)})))])
user system elapsed
0.01 0.00 0.02
> system.time(target[sort(unique(unlist(sapply(pattern, function(x) grep(x, target)))))])
user system elapsed
0.02 0.00 0.02
> system.time(target[apply(sapply(pattern,function(x)grepl(x,target)),1,any)])
user system elapsed
0.05 0.00 0.05


557:542
12/06/04 21:46:39.76
rowSums は apply(x,1,sum) のエイリアスだと思ってたら、
rowSums のほうが、だいぶ速いんだね。知らなかったよ。
> system.time(target[apply(sapply(pattern,function(x)grepl(x,target)),1,any)])
user system elapsed
0.05 0.00 0.05
> system.time(target[as.logical(rowSums(sapply(pattern,function(x)grepl(x,target))))])
user system elapsed
0.01 0.00 0.02


558:132人目の素数さん
12/06/04 21:52:36.36
>>557
投稿しようとしたら書かれてた
rowSumsはCで書かれてるはず
lapplyも同様
sapplyはlapplyを呼んでいる
applyはRで書かれていて遅い

559:542
12/06/04 22:04:53.47
>>558
へえ。applyは、なるべく避けた方が良さげですね。勉強になりました。


560:132人目の素数さん
12/06/04 23:15:00.88
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561:132人目の素数さん
12/06/05 07:03:58.00
R.exeのインストールされていないwindowsPCで、R言語で書かれた
プログラムを実行する手段はありますでしょうか。
(Fortranの実行ファイルみたいなイメージです)

562:132人目の素数さん
12/06/05 07:09:23.62
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.     |   \ ∠イ  ,イイ|    ,`-' |      頭が良くて数学が出来てかっこいい人。それが必要条件よ。
     |     l^,人|  ` `-'     ゝ  |        さらに Ann.of Math に論文書けば十分条件にもなるわよ。
      |      ` -'\       ー'  人          一番嫌いなのは論文数を増やすためにくだらない論文を書いて
    |        /(l     __/  ヽ、           良い論文の出版を遅らせるお馬鹿な人。
     |       (:::::`‐-、__  |::::`、     ヒニニヽ、         あなたの論文が Ann of Math に accept される確率は?
    |      / `‐-、::::::::::`‐-、::::\   /,ニニ、\            それとも最近は Inv. Math. の方が上かしら?
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563:132人目の素数さん
12/06/05 15:37:11.75
SAS使用歴20年、R半年の者です。
RにはSASで言うところのマクロみたいな物はないでしょうか?

564:132人目の素数さん
12/06/05 20:30:53.61
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        , '´  _. -‐'''"二ニニ=-`ヽ、
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     |     l^,人|  ` `-'     ゝ  |        さらに Ann.of Math に論文書けば十分条件にもなるわよ。
      |      ` -'\       ー'  人          一番嫌いなのは論文数を増やすためにくだらない論文を書いて
    |        /(l     __/  ヽ、           良い論文の出版を遅らせるお馬鹿な人。
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565:132人目の素数さん
12/06/05 22:40:37.65
R2.15.0でRODBCとXLConnectを同時に使用しようとすると名前空間エラーがでませんか?

566:132人目の素数さん
12/06/06 00:22:27.48
          __ノ)-'´ ̄ ̄`ー- 、_
        , '´  _. -‐'''"二ニニ=-`ヽ、
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567:132人目の素数さん
12/06/07 09:54:47.13
放置されて可哀想なので、私には答える能力がないけど、答えてみる。

>>561
?compiler::compile
このあたりを入り口に文献を読んでみて。
ところで、R.exeが入ってなくても、R.dllは入れてもいいの?
やりたいことを達成するには、Cなどで書いて、
R.dllが一緒にインストールされるソフトを作成する必要がある気がする。

>>563
SASはほとんど使った経験がないから、回答する資格がないけど、
R言語そのものがRのマクロとも言えます。
お手元のR入門書の「関数化」の項を読んでみてください。

>>565
異なる作者による同じ目的のパッケージだと、そのようなことは起こるかも知れません。
何千もある投稿パッケージの全てにおいて整合性がとれているわけではありません。
再現性が確認できたら、RODBCとXLConnectのメンテナに報告するとよいでしょう。

568:132人目の素数さん
12/06/09 23:34:52.27
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569:132人目の素数さん
12/06/10 06:29:56.30
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570:132人目の素数さん
12/06/13 20:54:59.86
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571:132人目の素数さん
12/06/18 14:21:06.94
Rjpwikiの「Rだけでデータクリーニング」。
真摯な回答をする人が何人もいて、偉いな。

572:132人目の素数さん
12/06/22 16:40:13.73
荒らされていてここじゃ書きずらくないですか?
Rってプログラミング言語なのでプログラムスレッドに移住するそうですよ。
無理にとは言わないので出来たらお願いしますね。

統計解析R たぶんpart3くらい
スレリンク(tech板)

573:132人目の素数さん
12/06/24 14:58:20.27
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574:542
12/06/27 21:28:07.95
sqldf package が便利なことに気付いた。


575:132人目の素数さん
12/06/27 22:14:18.48
OpenOffice Calcのファイル.odsから直接Rのデーターフレームに
読み込む方法はないかなあ。
cvsに変換して読み込んでいるけど、ちょっとだけメンドイ。

576:132人目の素数さん
12/06/28 13:28:01.62
>>575
read.ods() from ROpenOffice
URLリンク(www.omegahat.org)

577:132人目の素数さん
12/06/28 16:25:13.46
>>576
サンクス!
CRAN関連ばかり探していたから引っかからなかった訳だ。
ダウンロードして見たが、CRANじゃないのでインストール方法が判らん。
初心者なんでもうちょっと勉強してみる。

578:132人目の素数さん
12/06/28 16:40:01.10
>>577
$ sudo R CMD INSTALL Rcompression_0.93-2.tar.gz ROpenOffice_0.4-0.tar.gz
でOK。

Rcompressionがない状態でROpenOfficeをインストールしようとすると、
$ sudo R CMD INSTALL ROpenOffice_0.4-0.tar.gz
* installing to library ‘/usr/local/lib/R/site-library’
ERROR: dependency ‘Rcompression’ is not available for package ‘ROpenOffice’
* removing ‘/usr/local/lib/R/site-library/ROpenOffice’
とおこられちゃう。

Windowsで R CMD INSTALLを使う場合は、 別途Windows toolsetが必要らしい。
URLリンク(cran.r-project.org)

579:132人目の素数さん
12/06/28 17:39:04.25
>>578
重ね重ね丁寧に答えていただき、有難うございます!

580:132人目の素数さん
12/07/02 23:44:45.34
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581:575
12/07/04 19:45:39.22
Window toolsetがイマイチ判らず、ROpenOffice試せずにいたのですが、
Googleドキュメントのspreadsheetで read.csv("URL") から直接データーを
取り込めることを知り、色々試しているところです。
現時点では、spreadsheetのセル内に日本語使用すると、read.csv 失敗します。
英文字のみであれば、問題なく取り込めています。
バージョンの新しRだど2byte文字処理で不具合出るという話もあったので、
現状では出来るだけ日本語使用しないほうが良いみたいですね。

それから、Google spreadsheet をcsv形式でダウンロードしたファイルは、
Shift-JISにデコードし直さないと read.csv で取り込めませんでした。
UTF-8形式だったから読み込めなかったのかなあ。
まあそれでも Google spreadsheet が使えることが判ったので、
データー入力ツールはこれでいくことにします。

582:132人目の素数さん
12/07/05 09:17:17.75
>>581
ヘルプぐらい読んでもよいと思うよ。
fileEncoding: character string: if non-empty declares the encoding used
on a file (not a connection) so the character data can be
re-encoded. See the ‘Encoding’ section of the help for
‘file’, the ‘R Data Import/Export Manual’ and ‘Note’.

encoding: encoding to be assumed for input strings. It is used to mark
character strings as known to be in Latin-1 or UTF-8 (see
‘Encoding’): it is not used to re-encode the input, but
allows R to handle encoded strings in their native encoding
(if one of those two). See ‘Value’.


583:575
12/07/05 19:39:30.67
>>582
サンクスです! help読んでなかった・・・・
read.casv("file name", encording="UTF-8")で無事読み込めました。
これでだいぶ助かります。

584:132人目の素数さん
12/07/11 12:33:21.72
URLリンク(www.facebook.com)
てっきり高校生か未熟な大学生と思っていたら、
案外おっさんだったw
老けて見えるだけかな。

何にせよ、某所には、公共性の高いものだけに絞って書き込んで、
それ以外は、ここ(2ch)に書き込んで欲しいぞ。

c(letters[1:26])とか、初心者や入門者を混乱させることを目的とした
嫌がらせとしか思えないぞ。

585:132人目の素数さん
12/07/20 12:52:33.55
Mac OSX, Cocoa 環境でアプリ内から/Library/Frameworks/R.framework/Resources/にある実行ファイルを叩いてRを使っています。
[ NSTask launch... ] といった感じです。

しかし、スクリプトの末尾にq()を付けてもRの実行ファイルが動いたままになります(アクティビティモニタで確認)。
NSTask のterminateを呼び出しても消えてくれません。

どうもこれが悪さをして意図した動作をしてくれ内容です。
対処方法ご存知のかたがいましたらご回答をお願いします。

586:132人目の素数さん
12/07/20 13:15:11.45
>>585
q()の引数saveを省略すると"ask"になるのでは?
ヘルプには
| The default is to ask in interactive use but may be overridden by
| command-line arguments (which must be supplied in non-interactive
| use).
って書いてある。

つまり、実験せずに書くが、q()と書いても、入力待ちプロンプトで無限ループになってる気がするぞ。

587:132人目の素数さん
12/07/20 13:52:36.69
>>585
q("no")

とすれば、入力待ちにならないのでは?


588:132人目の素数さん
12/07/20 14:00:19.17
レスありがとうございます。
q()の引数にnoを追加しましたが、依然挙動不審です。
どうもコマンド引数に < script.r と指定したスクリプトを読み込めない場合があるようです。
なんこれ? な状況ですが。
最小単位の構成から実験してみます。


589:132人目の素数さん
12/07/20 14:05:39.29
>>585
いずれにせよ、q("no")やq("yes")は関係ない。
それらがなくても処理は終了する。
$ echo 'a <- 1' > /tmp/tmp.R
$ echo 'print(a)' >> /tmp/tmp.R
$ /Library/Frameworks/R.framework/Resources/R CMD BATCH /tmp/tmp.R out.txt
$ tail -7 out.txt
> a <- 1
> print(a)
[1] 1
>
> proc.time()
ユーザ システム 経過
0.825 0.051 1.074
ちゃんと終了する。

590:589
12/07/20 14:09:30.38
あと、
$ ls -l $(which R)
lrwxr-xr-x 1 root wheel 47 4 27 16:45 /usr/bin/R -> /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R
だから、普通に
$ R CMD BATCH スクリプト 結果ファイル
でいいよ。

591:馬鹿を焼く描写 ◆ghclfYsc82
12/07/22 16:58:54.77
★★★学歴格差:無意味
★★★学力格差:尊重しろ
★★★能力格差:最大限利用せよ。
東大や京大にだって馬鹿は沢山居てるんだヨ。

学力格差と能力格差を認める理想社会を実現しろや。要するに:
★★★『馬鹿は無意味なので不必要だから、従って無能は静かにせよ。』★★★
っちゅうこっちゃ。低脳が騒ぐのはワシが許さんのや。

ちゃんと読め。




592:132人目の素数さん
12/07/26 09:47:52.47
行列の作り方について質問です
xという1×n個の配列があって、
yという行列の要素を
y[i][j] = x[i]+x[j]としたいとき、
y行列を作る文はどのようにしたら良いのでしょうか


593:132人目の素数さん
12/07/26 10:44:18.59
>>592
> n <- 10
> x <- 1:n + 10
> x
[1] 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20
> outer(x, x, "+")
[,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [,6] [,7] [,8] [,9] [,10]
[1,] 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31
[2,] 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32
[3,] 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33
[4,] 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34
[5,] 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35
[6,] 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36
[7,] 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37
[8,] 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38
[9,] 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39
[10,] 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40

こういうことか?

594:132人目の素数さん
12/07/26 11:55:59.91
>>593さま
そうです!
ありがとうございます!
助かりました

595:132人目の素数さん
12/07/26 12:08:58.20
>>594
助かったのなら何よりなんだけど、
宿題の類だったのなら、確認もせずに教育の邪魔をして教員に申し訳ない。

596:132人目の素数さん
12/08/05 22:25:40.52
n=1,2,...,Nに対してP(n)のデータがあります
このデータがどの確率分布か言い当てることはできますか

597:132人目の素数さん
12/08/05 23:48:09.66
>>596
これまた宿題っぽい。
質問の動機や、動機を得るに至った背景を説明してもらえますか

598:132人目の素数さん
12/08/07 01:02:34.43
>>597
R触ってみようと思って最初に思い浮かんだのがこれ
なんだけど探しても見つからないもんだからここで聞くことにした

599:132人目の素数さん
12/08/07 04:10:01.29
>>598
ググると「コルモゴロフ-スミルノフ検定」というのが出てきた。


600:132人目の素数さん
12/08/07 13:49:09.80
>>596
>>599さんの答えだけだと、初心者はどうしてよいか分からないと思うので助言します。

> RSiteSearch("Kolmogorov-Smirnov")

以上。

601:132人目の素数さん
12/08/08 15:54:24.83
Mac版Rのデフォルトでのフォントって何でしたっけ?
コマンド入力中にうっかりよくわからないキー押してしまったみたいでフォントが変わってしまって・・。

602:baka描 ◆ghclfYsc82
12/08/08 17:29:54.67


>14 名前:132人目の素数さん :2012/08/07(火) 17:39:00.96
> >>13
> 旧コテ猫あらため描つまりお前自身の事だろ、増田哲也に限り無く近い人間。
> 筑波大学で痴漢と言えば増田哲也だから連続性も明らかになってるから
> わざわざ限り無く近い人間なんて呼び方しなくていいんだけどな
>


603:132人目の素数さん
12/08/08 19:18:57.57
          __ノ)-'´ ̄ ̄`ー- 、_
        , '´  _. -‐'''"二ニニ=-`ヽ、
      /   /:::::; -‐''"        `ーノ
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      |   |::/ / / |  | ||  | | ,ハ .| ,ハ|
      |   |/ / / /| ,ハノ| /|ノレ,ニ|ル' 
     |   |  | / / レ',二、レ′ ,ィイ|゙/   私は只の数ヲタなんかとは付き合わないわ。
.     |   \ ∠イ  ,イイ|    ,`-' |      頭が良くて数学が出来てかっこいい人。それが必要条件よ。
     |     l^,人|  ` `-'     ゝ  |        さらに Ann.of Math に論文書けば十分条件にもなるわよ。
      |      ` -'\       ー'  人          一番嫌いなのは論文数を増やすためにくだらない論文を書いて
    |        /(l     __/  ヽ、           良い論文の出版を遅らせるお馬鹿な人。
     |       (:::::`‐-、__  |::::`、     ヒニニヽ、         あなたの論文が Ann of Math に accept される確率は?
    |      / `‐-、::::::::::`‐-、::::\   /,ニニ、\            それとも最近は Inv. Math. の方が上かしら?
   |      |::::::::::::::::::|` -、:::::::,ヘ ̄|'、  ヒニ二、 \
.   |      /::::::::::::::::::|::::::::\/:::O`、::\   | '、   \
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604:132人目の素数さん
12/08/08 21:07:17.90
          __ノ)-'´ ̄ ̄`ー- 、_
        , '´  _. -‐'''"二ニニ=-`ヽ、
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     |     l^,人|  ` `-'     ゝ  |        さらに Ann.of Math に論文書けば十分条件にもなるわよ。
      |      ` -'\       ー'  人          一番嫌いなのは論文数を増やすためにくだらない論文を書いて
    |        /(l     __/  ヽ、           良い論文の出版を遅らせるお馬鹿な人。
     |       (:::::`‐-、__  |::::`、     ヒニニヽ、         あなたの論文が Ann of Math に accept される確率は?
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605:132人目の素数さん
12/08/12 19:33:37.42
Rで、グラフとして描画されているデータをテキスト出力出来ますか?

Rを使える人が私以外いないので、
Excelで配布しなければなりません。

今は描画前の関数データを張り付けていますが、
縦軸が変わってしまうので、グラフ描画からそのまま出力したいと思っています。

606:132人目の素数さん
12/08/13 09:08:15.60
>>605
意味が分からない。
> Rで、グラフとして描画されているデータをテキスト出力出来ますか?
Rグラフィックで描画するには、描画するためのデータがあると思うのだけど。
もしそうなら、そのままテキスト出力すればよいと思うが、
そんなことをわざわざ質問するとは思えないから、よく分からない。
テキスト出力とExcelの関連も意味不明。
> a <- data.frame(x=runif(10), y=runif(10))
というデータフレームがあったとして、
> plot(a)
とRグラフィックに描画して、次のようにすればテキスト出力される。
> a
x y
1 0.1401729 0.223354073
2 0.8426009 0.880151101
3 0.2795089 0.002605373
4 0.8179064 0.131089282
5 0.3903741 0.580761547
6 0.1708031 0.793535840
7 0.8964184 0.198217040
8 0.6109237 0.136335747
9 0.7519352 0.367561028
10 0.6382441 0.429468494


607:132人目の素数さん
12/08/13 09:53:15.56
>>606
なるほど。データフレームにしてしまえばトラブルを解消できそうです。

今まで、xとyを別々に指定するような作業をしていたので気が付きませんでした。
ありがとうございました。

608:132人目の素数さん
12/08/26 09:50:32.98
教えてください。

開始日,数
1,5
2,2
3,4
4,8
……
30,5

のような時系列データの信頼区間やピークを求めたいのですが、
解説サイトとかないでしょうか。

609:132人目の素数さん
12/08/27 11:10:35.51
>>608
ピークを得るためには、当てはめる関数の形が必要でしょう。
あなたの研究対象に対する先験的知識が本質的に必要だと思われます。

例えばポアソン分布に当てはめられるタイプのデータだと次のようになります。
d <- data.frame(x=1:30, y=round((dpois(1:30,10) + runif(30, max = 0.01))*100))
barplot(d$y, names.arg = 1:30)
こんなサンプルデータで、nls()を使って、
m1 <- nls(y ~ (a * (lambda^x*exp(-lambda)/gamma(x+1)) + b),
start = c(a = 1, b = 1, lambda = 10), data = d)
とすると、
> max(predict(m1))
[1] 13.14048
> which.max(predict(m1))
[1] 9
9日目で最大値13のピークになることが分かります。


610:132人目の素数さん
12/09/14 21:05:08.72
windowsXP世代の4GBマシンで100万レコードオーダーのdataframeを
ggplot2で描画しようとするとメモリオーバーになってしまう
なんかうまい方法はないものか

611:132人目の素数さん
12/09/15 00:15:23.75
>>610
分割して描画すればどうなる?
ggplot2じゃないけど、例えばこんな風に。
> d <- data.frame(x = runif(100), y = runif(100))
> plot(d[1:25, ], xlim = range(d$x), ylim=range(d$y))
> points(d[26:50, ])
> points(d[51:75, ])
> points(d[76:100, ])

612:132人目の素数さん
12/09/15 09:17:37.47
>>611
どうもです
確かに仰る通り、::baseのplotならば可能です

後だしですんませんが
・見た目のキレイさ
(というか先進性というか凄いことやってそうに見せられるというか。。苦笑
・カテゴリカル変数20こ程度
・引き継ぎやデータ更新等を考えて
作図のためのデータハンドリングのコーディングは最少にしたい
・自分自身の興味w

のような趣旨でggplot2でやりたいのです

613:132人目の素数さん
12/09/15 20:06:17.90
>>610
32bit?64bit?

614:132人目の素数さん
12/09/15 21:09:24.15
>>613
32bitです
会社の端末なんで詳細は不明ですが
5年くらい前の型で家庭用PCです
Rは2.15.0でパッケージは最新です
ggplot2_0.9.2.1


615:132人目の素数さん
12/09/15 22:21:52.64
          __ノ)-'´ ̄ ̄`ー- 、_
        , '´  _. -‐'''"二ニニ=-`ヽ、
      /   /:::::; -‐''"        `ーノ
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.     |   \ ∠イ  ,イイ|    ,`-' |      頭が良くて数学が出来てかっこいい人。それが必要条件よ。
     |     l^,人|  ` `-'     ゝ  |        さらに Ann.of Math に論文書けば十分条件にもなるわよ。
      |      ` -'\       ー'  人          一番嫌いなのは論文数を増やすためにくだらない論文を書いて
    |        /(l     __/  ヽ、           良い論文の出版を遅らせるお馬鹿な人。
     |       (:::::`‐-、__  |::::`、     ヒニニヽ、         あなたの論文が Ann of Math に accept される確率は?
    |      / `‐-、::::::::::`‐-、::::\   /,ニニ、\            それとも最近は Inv. Math. の方が上かしら?
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616:132人目の素数さん
12/09/17 13:49:31.71
ggplotでも分割してできるでしょ。
それでも最後の描画の際にエラーになっちゃうかな?

617:132人目の素数さん
12/09/18 00:00:46.90
>>616
はい。
ggplot2オブジェクトにそうさをくわえることはできますが、
プロットするさいにメモリオーバーエラーとなってしまいます。
(プロットせずにggsaveしようとしてもおなじです)


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