14/03/09 09:41:14.46
記者さんやっぱりChIP seqが鍵ですね。
以下のkahoさんのデータをわかりやすく解説してみました。
Oct4
URLﾘﾝｸ(genome.ucsc.edu)
4つのグラフが縦にならんでいます。このパターンがOct4遺伝子の指紋の
ようなものでバーコードと考えて下さい。上から同様に
①酸処理する前のCD45+細胞のパターン(Oct4の遺伝子あり)
②ES細胞(Oct4の遺伝子なし)
③酸処理後のstap細胞のパターン(Oct4の遺伝子なし)
④stap幹細胞のパターン(Oct4の遺伝子なし)
見事に、①にあったOct4遺伝子が③④で消失しています。ちなみにES細胞は②です。
つまり，CD45+細胞だけがOct4-GFPを発現する細胞で，それ以外
は違う細胞を使っています．調べた所CD45+以外の細胞にもGFPの配列はあり
ました．従って，これらは論文に使われている，恒常的に蛍光を発する
CAG-GFP細胞であろうと考えられます．つまり、①ではOct4が発現すると緑に光るが
③④では、Oct4の発現の関わりなく緑に光ります。