12/02/14 21:59:02.35
類似画像を検出するソフトを作って、オンラインの全論文を調べたら、
とんでもないことになりそうだが、
明らかにやった方がいいな
詳しくないんだけど、大変なのかい
明るさとコントラストの変更、回転操作をされても検出するソフトを作るのは
423:名無しゲノムのクローンさん
12/02/14 22:09:33.91
ツーか、ウェスタンのバンドとか殆ど類似と認識されるんじゃね？
普通だったら特徴らしい特徴が殆どないから。
424:名無しゲノムのクローンさん
12/02/14 22:11:20.80
論文 捏造 でググル先生に伺うと2chを薦めてくる件ｗ生物板は精神衛生上良くないのでもう大分長いこと見ていない。
425:名無しゲノムのクローンさん
12/02/14 22:19:14.35
さあ、次のターゲットだ。
Dear Editors,
I believe that some of the figures have been fabricated in the publication:
The RNA-Binding Protein KSRP Promotes Decay of β-Catenin mRNA and Is Inactivated by PI3K-AKT Signaling
Roberto Gherzi, Michele Trabucchi, Marco Ponassi, Tina Ruggiero, Giorgio Corte, Christoph Moroni, Ching-Yi Chen, Khalid S Khabar, Jens S Andersen, Paola Briata Paola Briata
PLoS Biology: Research Article, published 19 Dec 2006 10.1371/journal.pbio.0050005
Please have a look at the attached annotated copies of Fig 6 and Fig 7 from this publication.
Not only are there multiple illegitimate duplications and pastes, there are also controls that have been copied from Figure 2 of a paper in Molecular Cell 20:891 published by the same authors in 2005.
(Incidentally, this 2005 paper also contains images that appear to be fabricated.)
Could you please handle this matter according to the COPE guidelines, and please acknowledge receipt of this message by replying to this email.
Yours sincerely,
426:名無しゲノムのクローンさん
12/02/14 22:48:07.61
そろそろ、息切れか？
427:名無しゲノムのクローンさん
12/02/14 23:16:04.45
ここは日本人著者について語るとことです。無視していきましょう。
428:名無しゲノムのクローンさん
12/02/14 23:29:04.55
たしかにちょっと息切れ気味か。今集中的に最近のTKBの論文を調べてるんだが、
心を入れ替えたようにゲルに切れ目がない。Supplementのコントロールのレーンなんか、
これまでの例でいったら間違いなく大漁なんだが、極めて自然。
独立してから心を入れ替えたようにも見えるが、、、
だからって許されるって訳じゃないと思うよ。過去に遡ってまでも裁かれる。それぐらいしなきゃ、
業界は健全に保たれない。
429:名無しゲノムのクローンさん
12/02/14 23:31:45.92
だれか、バンド画像を作り出すアプリ書いてくれ。ImageJのプラグインでいいから。
430:名無しゲノムのクローンさん
12/02/14 23:47:20.58
つまりTKBは白か。よかったよかった。
431:名無しゲノムのクローンさん
12/02/14 23:48:31.98
>>428
K藤研の仕事の全てで捏が見つかる訳じゃないように、良心を持った人間は腐った中に
も必ずいて自身の仕事だけは汚されないように守っているだけのことだと思う。誰の仕
事かがポイントなのでは？
432:名無しゲノムのクローンさん
12/02/14 23:49:25.66
筑波大学 Ｙ澤研究室 論文画像コピペ疑惑集
Alleged image manipulation (Yanagisawa lab at Tsukuba university)
URLﾘﾝｸ(tsukuba-yanagisawa.blogspot.com)
SUMMARY of alleged image manipulation
Article No.1 → J Biol Chem. 2010 May 7;285(19):14747-55.
URLﾘﾝｸ(tsukuba-yanagisawa.blogspot.com)
Article No.2 → Cell. 2008 May 16;133(4):627-39.
URLﾘﾝｸ(tsukuba-yanagisawa.blogspot.com)
Article No.3 → Mol Cell Biol. 2006 Nov;26(21):7966-76.
URLﾘﾝｸ(tsukuba-yanagisawa.blogspot.com)
Article No.4 → EMBO J. 2006 Mar 8;25(5):1081-92.
URLﾘﾝｸ(tsukuba-yanagisawa.blogspot.com)
Article No.5 → EMBO J. 2004 Dec 8;23(24):4813-23.
URLﾘﾝｸ(tsukuba-yanagisawa.blogspot.com)
Article No.6 → EMBO J. 2004 Apr 7;23(7):1598-608.
URLﾘﾝｸ(tsukuba-yanagisawa.blogspot.com)
433:名無しゲノムのクローンさん
12/02/14 23:49:41.80
蚊刀が辞めれば、Y澤が東大に御栄転。
434:名無しゲノムのクローンさん
12/02/14 23:52:36.73
Ｙ件は、Ｍ、Ｔ、Ｉ の３人が筆頭著者の論文に問題があるんだね。
435:名無しゲノムのクローンさん
12/02/14 23:53:28.47
>>431
筑波本人か？ 守れるわけないだろう。
誰も信用していない。
436:名無しゲノムのクローンさん
12/02/14 23:55:56.38
>>435
筑波本人はクロだろう。でも、ここの准教の仕事と論文はまともそうに見える。あくまで私見。
437:名無しゲノムのクローンさん
12/02/14 23:59:22.20
マジか？
病気の母ちゃんが哀れだな
438:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 00:03:29.27
病気の母ちゃん関係ない。
439:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 00:04:01.50
>>434
3バカMITか
URLﾘﾝｸ(www.nicovideo.jp)
440:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 00:04:11.43
筑波はKTほど有名ではなく、追求もきつくないから
おそらく処分無しだろう
441:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 00:05:43.23
URLﾘﾝｸ(ja.wikipedia.org)
加藤茂明 wikipedia
編集よろしく。
442:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 00:09:52.36
捏造！医科娘
443:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 00:45:30.87
>>441 google キャッシュより
加藤 茂明(かとう しげあき)[1]は、日本の分子生物学者。
東京大学分子細胞生物学研究所教授（2012年2月現在）。
共に共著の論文を多く書いた弟子として、北川 浩史
(群馬大学教授)、村山 明子(筑波大学講師)が挙げられる。
現在、研究室のホームページは事実上閉鎖されているが、
部署のホームページでは紹介されている[2]。
近年は、論文捏造問題に関して、積極的に発言をしている[3]。
444:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 00:46:13.47
大物の影に隠れてしまったが先行してた小物の方、府立医大の捏造問題は、その後どうなったか知ってる？
445:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 01:22:20.40
>>432
改めてまとめてみるとこれはひどいねー。
446:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 01:28:15.38
>>443
柳澤桂子の息子さんは？
447:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 01:35:50.47
>今集中的に最近のTKBの論文を調べてるんだが、
>心を入れ替えたようにゲルに切れ目がない。Supplementのコントロールのレーンなんか、
>これまでの例でいったら間違いなく大漁なんだが、極めて自然。
>独立してから心を入れ替えたようにも見えるが、、、
だから、
昔は同一メンブレン上で行ったウエスタン画像を必要なレーンだけ切り貼りするのは、不正じゃ無かったんだよ。
最近は投稿規定が変わって、それが禁止になったから、止めただけだろ。
448:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 01:37:41.62
>>432
論文間で捏転写が出て来ているのは興味深い。改めてK藤研の仕事を見直さないと駄目
だな。特にY澤が入っているものについては。ソフトが欲しい。
449:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 01:50:15.81
むしろ手口が巧妙化してきてる悪寒
レーン間の切り貼りを見えなくするようにぼかしたり、
バックグラウンドをわざとサチらせたりJPEG圧縮の圧縮度を上げたり
450:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 01:57:55.85
それならもう見破れないだろ。
だったら、そんな事に情熱燃やすより自分の仕事したら？
これまでだって捏造論文は沢山あっただろうけど、結局５年、１０年後も残っていくのは真実のみ。
大体、捏造とは言えないまでも、データの解釈間違いで結論が正しくない論文だって山ほどあるだろ。
451:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 02:09:47.81
しかし、amazonの書評はあれでいいのか。
単独著者の本ならともかく、単に編者の本に関しては、ふざけた書評を書かれて多くのまともな著者達は大迷惑だろ。
業務妨害で出版社に訴えられろ。
452:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 02:12:10.93
仕事しようと思ったらポストと金を用意せんといかんから、
それらが必要な人は他人の捏造を暴露して引きずり下ろすってのは悪くないと思うぞ。
453:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 02:14:56.45
お前らが必死で他人の捏造を探して時間を無駄にしている間に、
俺は自分の実験をして業績を上げ、開いたポストをゲットっと。
454:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 02:15:21.09
最新のScienceのAlzheimer治療薬の論文のFig.2Eの画像ってアーティファクトだよね？
Scienceでmanipulationが高頻度にあるなんて俺は信じたくない。
455:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 02:16:08.12
書き忘れました。
ここの人達は画像のアーティファクトに詳しそうなので相談して見ました。
456:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 02:34:26.61
>>453
でもわざわざ2chのこんなスレまでチェックして、おまけにレスまでしちゃうんだねｗ
不思議ｗ
457:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 02:36:11.56
他人の論文の内容は、まず間違いだと考えるのが研究者としてのあるべき姿です。
458:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 02:36:42.95
>>456
この時間だからなw
459:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 02:37:57.72
>>454
生憎今自宅なので確認できないけれども、不正についての話題ならスレチではないんじゃない？
それはともかく、Scienceにアルツハイマーの話なんていくらでもあるだろ
最新号にしたってvolとページくらい書いてあっていいんじゃないかね
460:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 02:38:11.35
サイエンティストとしての社会貢献の一つだと思ってます
461:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 02:46:26.05
>>457
そんなアホな、、、
他人の仕事は基本的には信じるのが研究者としてあるべき姿だろ
だからこそ、捏造の罪は重いわけで
そもそも、自分が仕事はじめるときに他の論文散々読むだろ
それを「解釈の誤りかもしれない」とか「手法的限界かもしれない」とは考えても「嘘をついてるかもしれない」とは考えない。
もしそんなことをしたら、それこそ自分にとって都合の良い論文を採用して都合の悪い論文を嘘と決め付ける人も出てくる。
そういうことをし始めると捏造する奴も出てくるんじゃねーの？
462:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 02:51:20.70
＞「嘘をついてるかもしれない」とは考えない。
このご時世で、さすがにそれは馬鹿だろ
463:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 02:57:49.47
>>459
失礼しました。2012 Feb 9. のEpub ahead of printで、ApoE-Directed Therapeuticsで始まる論文です。
PPARγ、特に神経疾患との関係には個人的に興味があるので、この論文の信憑性が気になった次第です。
464:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 02:58:33.25
あなたのメンターはまともな教育をしていませんね。
世の中の論文の７割くらいはどこかが間違っています。
（捏造という訳ではなく、解釈間違いも含めて）
自分の研究を始める時にはもちろん過去の論文をチェックしますが、多数の研究室から同じ結果が得られているかが重要です。
そんなデータは本当にごく一部だけです。
当然最近発表されたばかりの論文は、誰にも追試されていない訳ですから、全て疑ってかかる事になります。
465:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 03:17:47.14
すみません、内容も書き忘れてました。Figureの明るさを変えると背景が真っ黒になるのですが、
可能性としては画像を作る際にThresholdを設定して、それ以下のシグナルを全て“0”にしたと
いう可能性があると思いますが、プラークの周りが綺麗に四角になってるのですが、JPEGの圧縮
によるアーティファクトでこういうことが説明つくのでしょうか？
466:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 03:29:03.20
論文も違うのですが、私も465さんと同じよう周りが綺麗に四角になる
図を発見しました。どなたか詳しい方教えていただけませんか？
467:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 03:34:39.60
そりゃjpegのアーチファクトの可能性が高いな。
ブロックノイズ、モスキートノイズでググってみな。
バンドやプラーク周囲がもやもやした感じになっていたら、まずアーチファクト。
468:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 03:46:36.09
PDF上の画像はバンドの周りが四角くなったりするよ。
検証にはPDFじゃなくて元のjpg画像を使う。
469:454＝464
12/02/15 03:50:57.91
再考の結果、やっぱりアーティファクトの可能性が高いと思いました。
単に背景が比較的高いのをプラークを見やすくするために下げただけかも知れません。
お騒がせしました。
470:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 03:55:59.86
PDFだけじゃなくて、元のjpeg画像でも圧縮率が始めから高いものだとブロックノイズで、バンド周りが四角くなる。
JPEGは8×8ピクセルのブロック単位で圧縮を行うため、圧縮率を上げるとブロックの境界にノイズが発生します。
特に背景が白に近い場合、バンド周りがブロック状に浮き上がってくる。
見慣れると捏造かブロックノイズか見分けがつく様になるけどな。
例えばここ
URLﾘﾝｸ(blog.ddc.co.jp)
471:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 04:45:05.67
個別論としては今家なのでなんともだけど、一般論としてPDFファイルもJPEGファイルも画像圧縮にJPEG圧縮をしてる。
無圧縮で埋めることも可能だがファイルサイズがでかくなるので普通はあまりしない。
画像の劣化は解像度の低下(ピクセル数)と不可逆圧縮(ファイルサイズの小さい画像に近似するために切り捨てる情報の量)で
起きるので、PDFに埋め込んでる小さいJPEG画像よりはHTML fulltextから辿れる
高解像度JPEG画像の方がまだオリジナルデータに近いということでここでは主に後者を検討してる。
PDF埋め込みのピクセル数の少ない画像はJPEG圧縮の単位(ブロック)が相対的にでかくなるので劣化が結構出てくる。
ただ、それでも怪しいものは怪しいと分かる場合も当然ある。人為的なコピペ等と圧縮目的の近似とは
ノイズの出方は変わってくるからだ。
ではどのくらいノイズが乗ってくるかについては、figure内の文字がJPEG圧縮を一緒に受けている場合、当然ノイズが乗る。
さらに文字は曲線で、黒文字と白背景は一番諧調の差がでかいので、上記近似の影響が当然でてきて、
文字周辺のノイズの乗り方が最後のJPEG圧縮で起きうる劣化の程度の指標となる。
画像統合以前に起きた劣化についてはなんとも胃炎が。
472:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 04:57:18.54
同じくありがとうございました。471さんも実際の図についての詳しい説明ありが
とう！私が見ていたのはもともとバックが飛ばしてある図だったので、詳しく見る
ために明るさやコントラストをいじったために出てきたものということがわかり
ました。
473:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 06:15:42.57
>>425
何人（なに じん）？
>>444
陛下を御迎えした中にも居た金失門のｴﾛｲ人が
「あれは御仕舞いだ」と言ったとか。伝聞です。
将棋で言えば、何手数かかるか不明だが、
即詰みらしい？
474:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 06:31:15.44
URLﾘﾝｸ(tsukuba-yanagisawa.blogspot.com)
↑
昨夜までは、figure legend の一部に
日本語表記が残っていたが、いまは
すべて 英語化されてるようでつね。
GJ！
475:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 06:44:44.20
>>444
URLﾘﾝｸ(www.f.kpu-m.ac.jp)
↑
これは問題の講座のHPの1頁だが、
Ｍ氏の肩書が、市立●●●市民病院・副診療部長・兼循環器科医長 と
すごく格下げになっているのが良く解る！・・・信じられない降格人事である^^
某イソゲルハイム社 と アスＴラスは、ＧＪ!!^^
476:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 07:07:43.65
>>475
上のN先生も同じ肩書きなので、それこそコピペによる肩書きの捏造ではないか！
477:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 07:35:11.38
>>476
餅論 そーゆーことでつね！
さあ、この コリゲは 今から 何時間後に
なされるのでしょーか？
それとも 放置playのﾏﾏでしょーか？
某講座の工作員さんの質が解りますね。
某社と某社のMRさんの運命や烏賊煮？
478:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 07:38:58.30
二行目に教授って書いてあるけど？
479:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 07:51:20.94
>>461
あなたは素人か、あるいは老害
論文の引用は捏造と思ってもするもの
480:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 08:03:46.16
捏造に限らず、先行論文（もちろん、CNSクラス）の結論がおかしいことを指摘するに
はかなりの実験上の労力と文章力が必要だと思うけど。もちろんこちらもCNSレベルに
投稿する時だが。うちのボスがこだわり杉なだけ？
481:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 08:05:08.85
それが、脳減る学者のKO動物だったりしたら、違うフェノタイプがでたら鼻から信じてもらえない。
482:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 08:16:35.32
>>480
労力はかけないが文章には一工夫するね
エディタへのカバーレターにも最善を尽くし、リジェクトされたら諦めて次の雑誌
雑誌への拘りは、俺はかなり少ないかもしれない
100年後には、一定期間後にフリーで読める雑誌が勝ってると思ってるし
483:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 08:40:31.26
>>422
バンドの黒くなっている塊を認識させ、
塊の中の一番濃い点を認識させ、
一番濃い点から塊の端まで線分を引き、
線分上の黒い度合いを積算する
線分を360度回転させ、1度ずつこの積算を行う
この積算値を縦軸に、回転角度を横軸に曲線を書く
この曲線を微分した関数の類似度を比較する
でどうだろう？
484:名無しゲノムのクローンさん
12/02/15 10:27:23.12
>>475
>アスＴラス って、
カト研の方でも なにか話題になって内科医?