12/01/26 08:37:03.93
ネタ投下だお。コリゲで済まされそうだが、マテメソがお粗末。
NCB 2009
URLﾘﾝｸ(mcb.asm.org)
mouse GIOT-4 gene (GenBank accession no. NM_145624)
URLﾘﾝｸ(www.ncbi.nlm.nih.gov)
でmouseゲノムをサーチしてもマッチしない。
Mus musculus chromosome 8だといってるBACとESTは一応引っかかる。
BLATでPCR断片を調べてみた結果が以下。
URLﾘﾝｸ(genome.ucsc.edu)
human GIOT-4 gene (GenBank accession no. NM_021030)
>chr9:109988045-109988814 770bp CTGTGTGGGTGTCGAGAGCAAATG TGCCACTGTCATGGCTCAGCAATG
ちなみにこのプライマーはhuman genome + transcriptsをblastnしても全く引っかからないしNM_021030の配列中にもない
mouse GIOT-4 gene (GenBank accession no. NM_145624)
>chr9:59790956-59791160 205bp GGGCAGCACATCTTAGAAGC TTGCCAAAGCTGTTTCTCCT
上記のようにPCR増幅産物は全然関係ないMus Musculus Chr.9の配列。一体こいつらは何を定量してるんだ？
当然論文出す前に訂正後のプライマーを注文してるかどうかは調査してもらいたいところ。
あと、普通定量RT-PCRするときってイントロンまたぐようにプライマー設計するよな
それにpseudogeneだらけでゲノムひろいまくりのGAPDHなんか使うか？