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「ウルトラマンメビウス２ 皇帝の逆襲」
ＴＶ版で勝利をおさめた地球人とＭ７８星雲人。
しかし、皇帝は死んでおらず、その魔力により１００大怪獣＆超獣＆宇宙人軍団を復活させる。
ついには銀河連邦の勢力図も書き換えられ、Ｍ７８星雲人も劣勢を強いられることとなり、太陽系も地球以外はその手中に落ちる。
ＧＵＹＳメンバーも応戦するも対メテオール封印兵器によりその力を発揮できず、全員人質となる。
ＧＵＹＳメンバーのみならず、地球人を全員抹殺するという軍団の卑劣な脅迫により、地球にいたウルト６兄弟はついにその姿を現す。
地球のために命を明け渡す覚悟をする６兄弟。６兄弟は太陽エネルギーをすべて吸い取られた上、
ヒッポリトタールをかけられてその命を落とす。
そのときメビウス地球に再臨し、ＧＵＹＳメンバーを救出。しかしときすでにおそく、固まったウルトラ６兄弟は幾多の怪獣の手により粉々に粉砕されてしまう。
父、母も皇帝に捕らえられ、メビウスとＧＵＹＳもなすすべなく絶望的な状況となった。
そのとき、宇宙空間にキングからのウルトラサインが光った！（終わり 第３部に続く）