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1908年に、東京、神奈川、兵庫、新潟で522頭の感染が記録されている。
2000年3月25日から4月9日に宮崎県で3戸、5月11日に北海道1戸の感染が確認、6月9日には終息。
日本では92年ぶりの発生となった。
2010年の発症
4月9日、宮崎県都農町の畜産農家の和牛1頭に口腔びらん等の症状を確認。疑似患畜として確認。
4月16日、2頭が同様の症状。
4月19日、さらに1頭が発症。
4月20日、宮崎県都農町の畜産農家の和牛3頭が感染の疑いが確認された[2]。
4月21日、宮崎県川南町の乳肉複合畜産農家に飼養されていた6頭の牛に感染の疑いが確認された[3]。
4月25日、新たに4頭の感染が確認され、殺処分の対象は1108頭に上り、
農林水産省によると過去100年間で最多となった。
4月27日、宮崎県川南町にある宮崎県畜産試験場川南支場で飼育している豚5等についても、
口蹄疫に感染している疑いが確認された。
4月28日、当初の感染例から約70km離れた宮崎県えびの市の農家からも、
感染が疑われる牛が確認された。これまでの感染例はすべて宮崎県児湯郡であったが、
えびの市への感染拡大に伴い、移動・搬出の制限区域が鹿児島県の一部にも拡大された。