WinMASPHYCat SIMWinMASPHYC - 暇つぶし2ch■コピペモード□スレを通常表示□オプションモード□このｽﾚｯﾄﾞのURL■項目テキスト2:名無しさん＠そうだ選挙にいこう 00/10/30 17:39 ごめんなさい。私はわからないのですが、WinMASPHYCを利用している だけで書きこみさせてもらいます。 有機分子のMDをしているんだけど、MDをし終わった後に、電子状態を 計算することになると、MOPACに戻すのに一つ一つの分子を戻さなければ ならなくて非常に時間がかかる！ 集合体としての電子状態を計算できないものか何かいい方法ない？ 3:トラック野郎一番星 00/11/07 19:55 ガウシアンまたは、ＤＶＸ－αの電子状態計算ソフトを使うほうが、金額的にも、計算にもずっと安価にできます。 金のかかったソフトを使う前に、フリーウェアも探して見ましょう。 4:名無しさん＠１周年 00/11/08 23:31 >>3 両方とも分子軌道法のソフトですね。１さんのやっているような 動的な情報を追うのに不適では？２さんへのレスポンスだとしたら、 ＭＯＰＡＣはフリーウエアですよ。 たしか、Ames 研究所から ALCMD というフリーのＭＤプログラムが 出ています。TERSOFF ポテンシャルが使えます。 >>2 少々古いコードですが、国内のプロジェクトで汎用の第１原理分子 動力学法プログラムというものが作られました。少々古いので、 移植に手間がかかりますが、一応そういうものもあります。多分、 有機分子なら原子数が大きくなければなんとかなります。でも、 数百以上の巨大分子を追うのであれば、３さんがいうように反応 過程や構造緩和のできるプログラムを使う方がいいでしょう。 ソースが公開されているものを使ってフィルタープログラムを 書くか直接、入力データを作るように元のプログラムをいじった 方がいいでしょうね。 次ページ最新レス表示レスジャンプ類似スレ一覧スレッドの検索話題のニュースおまかせリストオプションしおりを挟むスレッドに書込スレッドの一覧暇つぶし2ch