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(8)シンジはゲンドウと対話する
ゲンドウの願いは「人類の心が等しく単一でユイと会える安らぎの世界」＝旧劇でシンジが望まなかった世界
シンジはミサトのガイウスの槍（他人の死をかけた願い）を受け取る。ゲンドウはシンジとの対話の中で、自らの弱さを認め、シンジの心のなかにあるユイと再会し退場する
→ アディショナルインパクトの依代はシンジへ。カヲルが現れ何を望むのかを聞く。シンジ「僕よりもアスカやみんなを助けたい」
(9)シンジは、アスカ、アヤナミを送り届ける。カヲルはシンジとの対話の後、加持に送られる
(10)シンジは、ガイウスの槍でネオンジェネシスを実行し、「時間も世界も戻さない。ただエヴァのない世界」を願う
(11)シンジは自らの初号機と13号機を槍で貫く。ユイとゲンドウがその身代わりになって消滅
すべてのエヴァは消滅し、エヴァインフィニティも元の魂(人間、動物）へと形を戻す
(12)浜辺で待つシンジ。シンジは既に自らの願いにより自身が虚構（ラフ絵）になっている。
(13)マリがシンジのもとにたどりつき改８を消滅させる、新たなエヴァの存在しない駅のホームにいた