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天正18年（1590）～慶長５年（1600）
本城 上田城（真田昌幸）
支城 沼田城（真田信之）
慶長５年（1600）～元和２年（1616）
本城 沼田城（真田信之）
支城 上田城 ※関ヶ原戦後、破壊されている。
元和２年（1616）～元和８年（1622）
本城 上田城（真田信之） ※本格的な再建はしていない。
支城 沼田城（真田信吉）
元和８年（1622）～
本城 松代城（真田信之）
支城 沼田城（真田信吉）
※上田城は寛永３年（1626）、仙石忠政により再建。