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特定区間
【北海道】白石─札幌、桑園─札幌、沼ノ端─苫小牧、五稜郭─函館【東北】川部─弘前、羽前千歳─山形、余目─酒田、安積永盛─郡山
【関東】新前橋─高崎、倉賀野─高崎、東神奈川─横浜、神田─東京、代々木─新宿
【中部】塩尻─松本、宮内─長岡、近江塩津─敦賀【関西】布施─鶴橋、岸里玉出─天下茶屋、山科─京都、新大阪⇔大阪、尼崎─大阪、
【中国】倉敷─岡山、備中神代─新見、伯耆大山─米子、海田市─広島、横川─広島、幡生─下関
【四国】佐古─徳島、佃─阿波池田、向井原─伊予市、北宇和島─宇和島、宇多津─丸亀、多度津─丸亀
【九州】久保田─佐賀、夜明─日田、吉塚─博多、城野─小倉
指向性区間(()内が、特定の経路とする。)
【関東】日暮里─上野（西日暮里方面～上野～三河島方面、尾久～上野～三河島方面、尾久～上野～田端～駒込方面、尾久～上野～田端～上中里方面）、大崎─品川（西大井方面～大崎～田町方面）、
鶴見─横浜（西大井・新川崎・武蔵小杉経由武蔵中原方面・武蔵小杉経由向河原方面～横浜～川崎方面・国道方面・新子安）
【四国】宇多津─坂出 (丸亀方面～坂出～児島方面)、【九州】折尾─黒崎(水巻方面～黒崎～東水巻方面)