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捜査は、捜査機関によってなされる。刑事訴訟法が規定する捜査機関としては以下が挙げられる。捜査権をもっている者は下記である。
一般司法警察職員（＝警察官）（刑事訴訟法189条2項）
特別司法警察職員（警察官以外の司法警察職員）（刑事訴訟法190条）
検察官（刑事訴訟法191条1項）、検察事務官（刑事訴訟法191条2項）
国税犯則事件の調査、公安調査庁・公正取引委員会・入国管理局・税関の調査などは捜査に類似するが、原則として行政上の処分を行うためのものであり、本来それらの結果が刑事手続に向けられたものではなく、捜査とは概念上区別されている。
なお、麻薬取締官は、麻薬及び向精神薬取締法により、特別司法警察職員としての権限が与えられている。
探偵等の一般人は、立ち入り禁止区域での所謂「捜査権」はありません。