臨床統計もおもしろいですよ、その1at HOSP
臨床統計もおもしろいですよ、その1 - 暇つぶし2ch249:卵の名無しさん
17/11/11 19:15:36.64 AQmX3Wf1.net
N13=100
N14=10
G13=rep(1,N13)
G14=rep(1,N14)
data=list(N13=N13,N14=N14,G13=G13,G14=G14)
G1314.model=stan_model('G1314.stan')
saveRDS(G1314.model,file='G1314.model.rds')
# G1314.model=readRDS('G1314.model.rds')
fitG1314 <- sampling(G1314.model, data=data, seed=1234)
fitG1314
stan_dens(fitG1314,separate_chains = TRUE)
i.imgur.com/aL2PSDM.png
mean se_mean sd 2.5% 25% 50% 75% 97.5% n_eff Rhat
p13 0.99 0.00 0.01 0.97 0.99 0.99 1.00 1.00 2500 1
p14 0.92 0.00 0.08 0.72 0.88 0.94 0.97 1.00 2834 1
d 0.07 0.00 0.08 -0.01 0.02 0.05 0.11 0.27 2837 1
lp__ -10.24 0.04 1.16 -13.44 -10.70 -9.88 -9.42 -9.09 979 1
> ms=rstan::extract(fitG1314)
> mean(ms$d<0)
[1] 0.09425


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