【R言語】統計解析フリーソフトR 第6章【GNU R】at MATH
【R言語】統計解析フリーソフトR 第6章【GNU R】 - 暇つぶし2ch748:132人目の素数さん
19/05/02 13:30:24.26 74c/hxJZ.net
twitter.com/tukuhae
ゴキブリネトウヨヒトモドキ奇形売春婦肉便器なつこババア滅多刺しにして解体しろ

749:132人目の素数さん
19/05/02 13:37:47.73 8Iminfbi.net
>>714
なるほど。
自分も機械学習やってるけど、R の方がやりやすいよ。ディープラーニングならPythonかもしれないけど

750:132人目の素数さん
19/05/02 18:56:28.17 zw8jEgb5.net
データ分析とか統計解析とかだとRかPythonかだね
機械学習よりは統計寄りだとRは仕事でもスタンダード、特にマニアックな統計解析だとRにしかパッケージがない
まあ使い慣れてるならRで機械学習やっても全然構わないけど

751:132人目の素数さん
19/05/03 01:30:52.83 z3krlkgk.net
>>710
サンクス
まあメモリが2Gなので

752:132人目の素数さん
19/05/03 01:33:11.23 z3krlkgk.net
>>717
少し前はRなんてだんだん廃れるみたいな雰囲気あったけど今はむしろ盛り返してデファクトな何時になってるからこの先10年は行きそうだなあ
機械学習特需でpythonの躍進はすごかったけど

753:132人目の素数さん
19/05/03 18:06:51.34 74TBOTfG.net
2Gって四則演算もままならないだろ

754:132人目の素数さん
19/05/11 16:40:31.81 d+R/7VHb.net
Rstudio初心者です。
データファイル名を変えてフォルダには変更名で保存されてるのに、読み込むともとの名前のままなんです。どうすれば変更後の名前になるのでしょう?

755:132人目の素数さん
19/05/12 20:48:36.39 R3SzgyK7.net
>>710
サンクス
当面は32ビット版で頑張る

756:132人目の素数さん
19/05/17 22:45:05.59 BQfw+Y+R.net
>>721
全く状況がわからん。
主語や目的語、必要な修飾語を省略せずに、分かるように説明しないと誰も助言できない。

757:132人目の素数さん
19/05/19 05:50:12.72 i0Ntz+gH.net
いつのまにかどうでもいい国の資格試験の選択科目にまでなったしな
なんなんだろう

758:132人目の素数さん
19/05/19 12:44:13.70 5B49QX4v.net
資格を馬鹿にする者は資格に泣く

759:132人目の素数さん
19/05/20 08:40:12.19 ys3TVMX0.net
資格にしがみついたらいつのまにか技術の進展から取り残された国がありましたとさw

760:132人目の素数さん
19/05/22 10:42:04.74 d0kaOjCb.net
>>721
それはsave, loadよ話か?

761:132人目の素数さん
19/07/11 19:34:28.29 A4GNZ5B3.net
Pivot_longer & wider

762:132人目の素数さん
19/07/20 11:06:35.86 bSAoQnjE.net
0645
ふうL@Fu_L12345654321
学コン1傑いただきました!
とても嬉しいです!
https://pbs.twimg.com/media/D-IuUuqVUAALnAB.jpg
https://twitter.com/Fu_L12345654321/status/1144528199654633477
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763:132人目の素数さん
19/08/06 14:27:52.67 Y8L07+xi.net
>


764:臨時地震板 > 【備えあれば】防災用品 非常食スレ121【憂いなし】 > https://mao.5ch.net/test/read.cgi/eq/1562388281/



765:132人目の素数さん
19/08/10 11:28:08.57 YonpeJMb.net
RってMac版とWindows版で優劣ないの?
今から始めるならどっちがオススメ?

766:132人目の素数さん
19/08/10 13:44:59.32 /UVOwF70.net
R自体に優劣はないが文字コード絡みの問題が多いWindows環境はおすゝめしない。

767:132人目の素数さん
19/08/10 17:55:47.97 OOGR/e7Y.net
Macはフォントで苦労するけどな

768:132人目の素数さん
19/08/10 21:06:01.89 7gPmJrDz.net
じゃ、Linuxだ。

769:132人目の素数さん
19/08/10 21:23:29.54 YonpeJMb.net
フォントで苦労ってどういう種類の?
文字化け?

770:132人目の素数さん
19/08/12 04:58:06.03 TcXjNI8s.net
>>731
R本体だとグラフィックディバイスに違いはあるけど、実質的に差はない。
でもRは本体だけで使うことは稀で、多種多様なGUIがあるから、
そこでOSの違いによる差が生じる。

771:132人目の素数さん
19/12/09 08:29:17 g2fJs3Gj.net
面白い問題スレにあったのでシミュレーションしてみた。

# サイコロ

# 正6面体のサイコロがある.4面は青色、2面は赤色である.
# このサイコロを合計20回振るとき、最も起こりそうな順番はどれか?
# 1.赤 青 赤 赤 赤
# 2.青 赤 青 赤 赤 赤
# 3.青 赤 赤 赤 赤 赤

sim <- function(){
a=sample(0:1,20, replace=TRUE, prob=c(4,2))
b=as.character(a)
c=paste(b,collapse="")
s1=paste(c(1,0,1,1,1),collapse="")
s2=paste(c(0,1,0,1,1,1),collapse="")
s3=paste(c(0,1,1,1,1,1),collapse="")
res=c(grepl(s1,c),grepl(s2,c), grepl(s3,c))
return(res)
}
k=1e6
re=replicate(k,sim())
mean(re[1,])
mean(re[2,])
mean(re[3,])

結果は、直感とおり、1が再頻

> mean(re[1,])
[1] 0.124672
> mean(re[2,])
[1] 0.080873
> mean(re[3,])
[1] 0.040564
>

grep使わない方法ってあるかな?

772:132人目の素数さん
19/12/10 18:31:14.56 KL6XgkNo.net
これって確率分布的には何になるんですっけ?

773:132人目の素数さん
19/12/11 10:39:16.38 xruQypao.net
歪んだコインやんか

774:132人目の素数さん
19/12/12 16:40:23 8G7On9nx.net
>>737
ワイの直感的解法

# 1.赤 青 赤 赤 赤
# 2.青 赤 青 赤 赤 赤
# 3.青 赤 赤 赤 赤 赤

だが、以下でも確率同じ。何となく
# 1.赤 赤 赤 赤 青 ★
# 2.赤 赤 赤 赤 青 青
# 3.赤 赤 赤 赤 青 赤
★は赤でも青でもどっちでもOK

P(# 1) >P(# 2) >P(# 3) ∵青出やすい

R言語等でシミュレーションされ、
自身の確率直感が正しいのを
確認できるとは、素晴らしい。

775:>>738
19/12/12 18:31:03 8G7On9nx.net
上記の件、若干の訂正とする

# 1.赤 青 赤 赤 赤
# 1'.赤 赤 赤 赤 青 とすると、
# 1と# 1'は、直感で同じ確率と
思ってたが間違えのようだ。

当方のシミュレーションで、
# 1は、0.1248
# 1'は、0.1271
となった。微妙だけど、多分だ。

やっぱり確率計算をコンピュータで
モンテカルロシミュレーションのは
素晴らしい。

776:132人目の素数さん
19/12/12 19:21:51.88 8G7On9nx.net
>>737
【grepは未使用の糞真面目な方法】
# 1.赤 青 赤 赤 赤
についての確率、ほぼ厳密解を得た
# 1は、0.124774… だと思う
計算は、モンテカルロ法でない方法
でプログラム、計算した。
で、grepは使用してない。
ちなみに計算誤


777:差は、ほぼ皆無なハズ ソースコードイメージ p01 = (1/3)^4*(2/3) p02 = p01 p03 = p01 * (1 - p01) p04 = p01 * (1 - p01 - p02) p05 = p01 * (1 - p01 - p02 - p03) … p16 = p01 * (1 - p01 - p02 - p03 … - p14) とし、 p01~p16 の合計を算出したところ、 0.124774…  となった



778:132人目の素数さん
19/12/13 07:46:08 lh0xGphL.net
>>740
レスありがとうございます。

私の直感

# 1.赤 青 赤 赤 赤
# 2.青 赤 青 赤 赤 赤
# 3.青 赤 赤 赤 赤 赤

# 1.を6個に書き換えて #2.と並べると
# 1.★ 赤 青 赤 赤 赤
# 2.青 赤 青 赤 赤 赤
★は赤でも青でもどっちでもOKだから#1.の方が起こりやすい

# 2と# 3を比べると
# 2.青 赤 青 赤 赤 赤
# 3.青 赤 赤 赤 赤 赤
3個めでは青の方がでやすいので
ら#2.の方が起こりやすい

よって、P(# 1) >P(# 2) >P(# 3)

779:132人目の素数さん
19/12/14 03:40:27.74 L1XaepqW.net
分からない問題スレから、
>>
1回3.6%で激レアが出るガチャを10回回した確率って
36%なのでしょうか?
それとも0.964*0.964*0.964(略 0.964を10回電卓にかけた数なのでしょうか?
教えてください。
<<
百万回シミュレーション
p=3.6/100
N=10
sim <- function() any(rbinom(N,1,p)==1)
mean(replicate(1e6,sim()))

> mean(replicate(1e6,sim()))
[1] 0.306628

780:132人目の素数さん
19/12/14 03:51:08 L1XaepqW.net
シミュレーション その2

gacha=c(rep(1,36),rep(0,1000-36))
sim2 <-function() any(sample(gacha,10,replace=TRUE)==1)
mean(replicate(1e6,sim2()))

> mean(replicate(1e6,sim2()))
[1] 0.306904

何故か0.36にならない、どうしてだろ?

781:132人目の素数さん
19/12/14 04:10:22.87 L1XaepqW.net
シミュレーションその3 (処理速度の関係で10万回の平均)
gacha=c(rep(1,36),rep(0,1000-36))
sim3 <- function() any(replicate(10,sample(gacha,1))==1)
mean(replicate(1e5,sim3()))
> mean(replicate(1e5,sim3()))
[1] 0.30691
これも0.307弱だな。
何が悪いんだろ? 俺の頭かな??

782:132人目の素数さん
19/12/14 05:45:07.83 qYB5MEbs.net
3.6%のガチャを10回回して全部外れる確率は
(1 - 0.036) ^ 10 ≒ 0.6930592
したがって、
3.6%のガチャを10回まわして1回以上当たる確率は
1 - 0.6930592 = 0.3069408

783:132人目の素数さん
19/12/14 08:18:13 L1XaepqW.net
>>747
ありがとう、
やっぱ、
これだったw
何が悪いんだろ? 俺の頭かな??

784:132人目の素数さん
19/12/14 08:19:41 L1XaepqW.net
>>748
シミュレーションにバグはなかったw

785:132人目の素数さん
19/12/14 12:29:26.79 cW38CJV+.net
小学生でも解けるぞ。がんばれ。

786:132人目の素数さん
19/12/14 16:29:58.85 QSWNkRNd.net
確率統計なんぞ無意味つまりインチキ
事実、結果こそすべて

787:132人目の素数さん
19/12/14 19:21:15.54 1VaGaO0p.net
その確率計算の激ナイーブな解法を示す
激レアは、レアだから1個とみなす。
故に、母集団の個数は
1÷0.036 = 27.777… きっと28個だ
手順1) 28枚のカードがある
手順2) 重複しない1~28の番号を振る
手順3) 28枚のカードをシャッフル
手順4) 1~10枚目のどれか1となる確率
と絶対同じハズ、だから、
P(1枚目で当) =27P27 ÷ 28P28 = 1/28
P(2枚目で当) も同様に1/28
P(3枚目で当) も同様に1/28

P(10枚目で当) も同様に1/28
で此等10個の事象は背反事象だから、
P = 10/28 = 0.357
 ∵有効数字3桁と勝手にしちゃう
ところてガチャってゲーム何か
よくわかんないけど、計算しちゃった

788:132人目の素数さん
19/12/14 20:44:12.02 1VaGaO0p.net
追記というか突然ですが、
そのガチャ3.6%の件、
超幾何分布なのか。二項分布なのか。
確率の小さいとか、母集団が小さい とかだと無視できないと思われる。
確率統計はギャンブル派生数学ぢゃ。
生半可な知識ではカモにされる。
現代の若者たちは、数学特に
確率統計はじめとするギャンブル
の能力が特段に欠けており、
R言語等のプログラミング教育で
ギャンブルゲームを学習すべきだ。
奇麗事の学問だけの今日の数学ぢゃ
カモにされるだけ。
健全な娯楽として賭博系確率統計学
をC R Java Pyson Javascript BASIC
の何れかを学校で学習すべきだ。

789:132人目の素数さん
19/12/16 09:18:31.40 t3hxiPBr.net
私のガチャのイメージは、
かつて、昭和の駄菓子屋によくある
ガチャガチャすなわちカプセルトイ
そのような健全的なギャンブルが
超幾何分布とか二項分布の理解に
役立つのだ。
限られたお小遣の10円玉数枚で、
如何にレアアイテムをGetするかを
子供らは、思考するからだ。
「残り物には福がある」は
確率統計的には正しいのか
子供同士で文学的に議論したものだ。
さて、今のガチャは恐らくは、
デジタルの媒体のスマホゲームだ。
二項分布でよいだろう。
R言語には、
二項分布の密度関数、それの累積関数
はモチロン、それに従う乱数生成を
提供してるようだ。
ゲームの仕組みが複雑化する今、
R言語等の乱数生成プログラミングで
これからのデジタル化ギャンブル社会
で、お金より大切な激レアをドンドン
無限にゲットできる人材の増加を
期待できる可能性を秘めている

790:132人目の素数さん
19/12/17 06:37:18.85 gnX7/8eN.net
カプセルトイ(ガチャ)1台に1000個カプセルが入っていて36個がアタリ(レアアイテム)とする。
同じカプセルトイが10台ある。カプセル取り出し後は補充されない。
アタリを1個でも手に入れる確率は
1台から10個取り出す場合(G10)と
1台から1個を10台で取り出す場合(G01)
ではどちらが高いか?
そのシミュレーション
rm(list=ls())
N=1000 ; K=36 ;n=10 # アタリ3.6%
g=rep(c(1,0),c(K,N-K))
G10 <- function() any(sample(g,n,replace=FALSE)>0) # 非復元(超幾何分布)
G01 <- function() any(sample(g,n,replace=TRUE )>0) # 復元(二項分布)
mean(replicate(1e6,G10()))
mean(replicate(1e6,G01()))

791:132人目の素数さん
19/12/17 08:10:38.97 gnX7/8eN.net
シミュレーションと理論値
> mean(replicate(1e6,G10())) ; 1-choose(N-K,n)/choose(N,n)
[1] 0.307745
[1] 0.3081121
> mean(replicate(1e6,G01())) ; 1-(1-K/N)^n
[1] 0.307295
[1] 0.3069408
1台から10個取り出した方がいいみたい。

792:132人目の素数さん
19/12/17 14:14:51.68 JPqkotiS.net
>>756 なるほど、
どの台も全部で、1000カプセルで、
どの台も当りが、36カプセルだと
G10(1台で10個)取り出す方が
僅かですが、確率良さそうですね。
シミュレーションも理論値も
同様な結論のようであり、
G10(1台で10個)取り出す方が僅かに
有利が分かり何か楽しかったです。
仮に、もしどの台も
250カプセル中当たり9カプセルなら、さらにG10戦略がG01戦略より有利な
感触を掴めました。

793:132人目の素数さん
19/12/17 15:44:13.73 gnX7/8eN.net
>>757
1000個だとシミュレーションの差が微妙で再現性が不安だったけど
250個にすると、差が明らかにつきますね。
> N=250 ; K=9 ;n=10 # アタリ3.6%
> g=rep(c(1,0),c(K,N-K))
>
> G10 <- function() any(sample(g,n,replace=FALSE)>0) # 非復元(超幾何分布)
> G01 <- function() any(sample(g,n,replace=TRUE )>0) # 復元(二項分布)
>
> mean(replicate(1e6,G10())) ; 1-choose(N-K,n)/choose(N,n)
[1] 0.31082
[1] 0.3117069
> mean(replicate(1e6,G01())) ; 1-(1-K/N)^n
[1] 0.306782
[1] 0.3069408

794:132人目の素数さん
19/12/18 14:18:29.16 GQllmBub.net
rhyper で超幾何分布の乱数を発生させることができたんだな。
これと rbinomを使うと sample関数を使わなくても同じことができた。
N=250 ; K=9 ;n=10 # アタリ3.6%
mean(replicate(1e6,rhyper(1,K,N-K,n)>0)) ; 1-choose(N-K,n)/choose(N,n) # 非復元(超幾何分布)
mean(replicate(1e6,any(rbinom(n,1,K/N)>0))) ; 1-(1-K/N)^n # 復元(二項分布)
結果
> mean(replicate(1e6,rhyper(1,K,N-K,n)>0)) ; 1-choose(N-K,n)/choose(N,n)
[1] 0.311581
[1] 0.3117069
> mean(replicate(1e6,any(rbinom(n,1,K/N)>0))) ; 1-(1-K/N)^n
[1] 0.307213
[1] 0.3069408
1台から順次10個取り出すのをイメージすれば残り物には福があるとも言えなくもないな。

>

795:132人目の素数さん
19/12/18 21:18:37 GQllmBub.net
"フランスの数学者パスカル(1623~1662)が1654年にフェルマーにあてた手紙が、現在の確率
論の始まりだと言われている。当時の有名な賭博師メレがパスカルに以下のような問題を持ち
込み、その問題についてがその手紙のやりとりの中で論じられているそうである。
甲乙二人がおのおの32ピストル(当時のお金の単位)の金を賭けて勝負したとする。
そしてどちらかが先に3点を得たものを勝ちとし、勝った方がかけ金の総額64ピストルをもら
えるとする。ところが甲が2点、乙が1点を得たとき、勝負が中止になってしまった。
このとき、二人のかけ金の総額64ピストルを甲と乙にどのように分配すればよいだろうか。
ただし二人の力は互角で、勝つ確率はそれぞれ1/2ずつだとする。"

# 先にw(=3)点を得たものを勝ち、甲がA(=2)点、乙がB(=1)点を得たとき、勝負が中止
# 甲の確率を求める

gambling <- function(A=2,B=1,w=3,k=1e5){ # k : how many simulate
sim <- function(){
while(A < w & B < w){
g = rbinom(1,1,p=0.5)
if(g==1){
A=A+1
}else{
B=B+1
}
}
A > B
}
mean(replicate(k,sim())) # Pr[A wins]
}

> gambling(2,1,3)*64 #64ピストル配分
[1] 48.13056
> gambling(2,0,4) # 日本シリーズ
[1] 0.80945

796:132人目の素数さん
19/12/19 09:59:55.45 V+OT4hGF.net
>>760の計算結果は、興味深い結果だ
で、
自己流の直感でラフな計算をしてみた。
甲1点、乙1点 ⇒1:1按分 ∵自明 ★
甲3点、乙1点 ⇒1:0按分 ∵自明 ☆
安直に★と☆の平均を考えると
甲2点、乙1点 ⇒1:0.5按分 ∵安直
で、総額で64ピストルだから、
甲に、64*1/1.5 = 42.67 ピストル
乙に、64*0.5/1.5 = 21.33 ピストル
を配分すれば、思ってしまった。
ラフな計算だと、少々不公平なことが
起こるようだ。
R言語等のシミュレーションは、
超天才のワィの直感より、
さらに厳密な確率計算ができそうだ。

797:132人目の素数さん
19/12/19 16:21:08.12 kVFzAP55.net
>>760
最後はAが得点して勝負が決定するのを忘れずにAが勝者になるまでのBの点数で場合分け
NS <- function(w,A,B,p){ # 先にw点得点した方が勝者、A,B:現在の点数 ,p:甲の勝率
ans=0
for(k in 0:(w-B-1)){ # k: Aが勝者になるまでのBの点数
ans=ans+choose(w-A-1+k,w-A-1)*(1-p)^k*p^(w-A)
}
return(ans)
}
> NS(3,2,1,0.5)*64 #64ピストルの分配
[1] 48
> NS(4,1,0,0.5) #日本シリーズで先勝したほうが優勝する確率
[1] 0.65625
NSは日本シリーズの頭文字から命名、No Skinではないww

798:132人目の素数さん
19/12/19 18:00:34.70 V+OT4hGF.net
賭博等の確率計算をイメージすると
ワィの脳内は


799:活性化される だから、 ドンドン、妄想全開となるぅぅぅ。 という訳で、妄想内容を記載する 17世紀の地球に行き、胴元になって 賭博ビジネスでガッポリ儲けるゼェ。 17世紀の地球で、胴元になって、 コイントス賭博事業をするゼェ。 で、システムは、2回コイントスし、 表の回数が0回⇒参加者が32万円GET 表の回数が1回⇒胴元に、32万円PAY 表の回数が2回⇒参加者が32万円GET 参加料は、1万円 まんまと、参加者が沢山 1000人いた ある参加者は、以下の様に怪説をした 組み合わせは、3通りだ。 1通り目 表の回数が0回 2通り目 表の回数が1回 3通り目 表の回数が2回 だから、参加者の勝つ確率は2/3だ で、モチロン、胴元ワィの商売は成功 およそ、1000万円儲かっちゃた。



800:132人目の素数さん
19/12/20 02:07:38.50 yiLw1Jz8.net
0745
しろ@huwa_cororon 11月27日
苦節6ヶ月、初満点&一等賞です!
URLリンク(twitter.com)
(deleted an unsolicited ad)

801:132人目の素数さん
19/12/21 10:49:06.51 +RV2yvS7.net
日本シリーズで賭けをする。
日本シリーズは先に4勝したチームが優勝。
勝率はそれまでの(引き分けを除いた)通算勝率に従うとする。
シリーズ開始前の通算成績はA:2勝、B:4勝であった。
今シリーズでAが先勝(第一試合に勝利)した。
この時点でA,Bのどちらに賭ける方が有利か?

802:132人目の素数さん
19/12/21 22:03:14.56 vLicX+v2.net
分からない問題スレで3進法の小数とかが話題になっていた
スレリンク(math板:845番)
>>
845 名前:132人目の素数さん[] 投稿日:2019/12/21(土) 05:52:50.74 ID:wum1jR1j
...
10進数で表された5/9を3進数になおせという問題があって、答は0.12だったのですが、
...
<<
こんなのを作ってみた。

# 小数点付きの数numをN進法で表示する
rm(list=ls())
dec2basen <- function(num, N, kmin = 5){ # kmin:最小小数点後桁
int=floor(num)
r=int%%N
q=int%/%N
while(q > 0){
r=append(q%%N,r)
q=q%/%N
} # rに整数のN進法表示を格納
x=num-floor(num)
k=max(nchar(x)-2,kmin) # 同長もしくはkminの長さの小数表示
a=numeric(k)
for(i in 1:k){
y=x*N
a[i]=floor(y)
x=y-a[i] # r . a[1] a[2] a[3] ... a[k]
}
if(N<=10){ # Nが10以下は数値として表示
cat(r,paste(".",paste(a,collapse = ''),sep=''),'\n',sep='')
}
else{ # Nが11以上は整数部分と小数部分を数列で表示
print(list(int=r,decimal=a))
}
invisible()
}

> dec2basen(5/9,3)
0.120000000000000
> dec2basen(3.14159265359,7)
3.06636514320
> dec2basen(3.14159265359,8)
3.11037552421
> dec2basen(3.14159265359,9)
3.12418812407
> dec2basen(3.14159265359,14)
$int
[1] 3
$decimal
[1] 1 13 10 7 5 12 13 10 8 1 4

803:132人目の素数さん
19/12/22 08:18:39.30 Ez3wWboE.net
>>766
バグの原因を追求したら、Rの仕様のせいみたいだな。
> (1.2-1)*5==1
[1] FALSE
> (1.2-1)*5>1
[1] FALSE
> (1.2-1)*5<1
[1] TRUE
これがfloor関数が誤値を返してくる原因だった。
> floor(1)
[1] 1
> floor((1.2-1)*5)
[1] 0

804:132人目の素数さん
19/12/22 08:52:46.43 UYCjcQMO.net
>>767
数値演算についてもっと勉強しな。
たいていの言語でそうなる。

805:132人目の素数さん
19/12/22 13:06:36.02 Ez3wWboE.net
すると、pythonに移植しても同じ結果ということか。
IPython 6.5.0 -- An enhanced Interactive Python.
C:\bin\Anaconda3\lib\site-packages\ipykernel\parentpoller.py:116: UserWarning: Parent poll failed. If the frontend dies,
the kernel may be left running. Please let us know
about your system (bitness, Python, etc.) at
ipython-dev@scipy.org
ipython-dev@scipy.org""")
(1.2-1)*5==1
Out[1]: False
(1.2-1)*5>1
Out[2]: False
(1.2-1)*5<1
Out[3]: True
(1.2-1)*5
Out[4]: 0.9999999999999998

806:132人目の素数さん
19/12/22 17:15:43.69 Ez3wWboE.net
round を使って回避することにした
> 0.728*5-3.64
[1] -4.440892e-16
> round(0.728*5-3.64,5)
[1] 0
んで、デバッグ版
# 小数点付きの数numをN進法で表示する(62進法まで対応 0-9,a-z,A-Z)
rm(list=ls())
dec62 <- function(num, N, kmin = 5){ # kmin:最小小数点後桁
int=floor(num)
r=int%%N
q=int%/%N
while(q > 0){
r=append(q%%N,r)
q=q%/%N
} # rに整数のN進法表示数列を格納
k=max(nchar(num)-nchar(floor(num))-1,kmin) # 同長もしくはkminの長さの小数表示
a=numeric(k)
x=round(num-floor(num),k) # e.g. 7.28-floor(7.28)-0.28 != 0に対応
for(i in 1:k){
y=round(x*N,k) # e.g. 0.728*5-3.64 !=0 に対応
a[i]=floor(y)
x=y-a[i] # r . a[1] a[2] a[3] ... a[k]
}
b=list(integer=r,decimal=a,num=sum(c(int,a)*(1/N)^(0:k)))
fig=c(0:9,letters,LETTERS)[1:N]
if(N<=62){ # Nが62以下は数値として表示
cat(paste(fig[b$integer+1],sep='',collapse=''),
'.',paste(fig[b$decimal+1],sep='',collapse=''),sep='')
cat('\n')
}
else{ # Nが63以上は整数部分と小数部分を数列で表示
print(b[1:2])
}
invisible(b) # b$num:検証用
}

807:132人目の素数さん
19/12/22 17:25:01.53 Ez3wWboE.net
>>769
Haskellでもやってみた
Prelude> (1.2-1)*5
0.9999999999999998
Prelude> 0.72*5-3.6
-4.440892098500626e-16

808:132人目の素数さん
19/12/25 07:12:30.44 oEKznZ6+.net
>>768
レスありがとうございました。
アドバイスに従ってちょっと勉強してみました。
他の言語に移植しても無駄とわかって助かりました。
こうなる理由が理解できました。
(1+1/10-1)*10==1
[1] FALSE
> (1-1+1/10)*10==1
[1] TRUE

809:132人目の素数さん
20/01/06 12:56:45.01 e9wyGMBv.net
からnまでの順列を列挙するスクリプト。
これをwhile使って高速化するにはどうすればいいだろう?
俺の頭では思いつかない。
perm <- function (n) {
v=1:n
sub <- function(n, v) {
if (n == 1)
matrix(v, 1, 1)
else {
x = NULL
for (i in 1:n) x =rbind(x, cbind(v[i], sub(n -1,v[-i])))
x
}
}
sub(n, v)
}

> perm(4)
[,1] [,2] [,3] [,4]
[1,] 1 2 3 4
[2,] 1 2 4 3
[3,] 1 3 2 4
[4,] 1 3 4 2
[5,] 1 4 2 3
[6,] 1 4 3 2
[7,] 2 1 3 4
[8,] 2 1 4 3
[9,] 2 3 1 4
[10,] 2 3 4 1
[11,] 2 4 1 3
[12,] 2 4 3 1
[13,] 3 1 2 4
[14,] 3 1 4 2
[15,] 3 2 1 4
[16,] 3 2 4 1
[17,] 3 4 1 2
[18,] 3 4 2 1
[19,] 4 1 2 3
[20,] 4 1 3 2
[21,] 4 2 1 3
[22,] 4 2 3 1
[23,] 4 3 1 2
[24,] 4 3 2 1
>

810:132人目の素数さん
20/01/06 21:34:47.52 yym51Tg7.net
>>773
自己解決 e1071というパッケージに再帰呼び出しなしのpermutationがありました。
library(e1071)
permu <- function (n) {
z <- matrix(1)
for (i in 2:n) {
x <- cbind(z, i)
a <- c(1:i, 1:(i - 1))
z <- matrix(0, ncol = ncol(x), nrow = i * nrow(x))
z[1:nrow(x), ] <- x
for (j in 2:i - 1) {
z[j * nrow(x) + 1:nrow(x), ] <- x[, a[1:i + j]]
}
}
return(z)
}

811:132人目の素数さん
20/01/09 14:28:06.78 rRnLkyt7.net
可変引数の扱い
Cで
#include <stdio.h>
int main(int argc, char* argv[])
{
while(argc--)
printf("%s\n", *argv++);
return 0;
}
をRでやるには ... を使って、c(...)もしくはlist(...)で引き出せばいいんだな。
検索してもなかなかわからなかった。
main <- function(...){
argv=c(...)
for(i in 1:length(argv)) cat(argv[i],'\n')
}

812:132人目の素数さん
20/01/15 18:08:54 l229ykjv.net
>>548
library(Rmpfr)

mpfr(factorial(50),5000)

one = mpfr(1, 5000)
factorial(one*50)


> mpfr(factorial(50),5000)
1 'mpfr' number of precision 5000 bits
[1] 30414093201713018969967457666435945132957882063457991132016803840
> one = mpfr(1, 5000)
> factorial(one*50)
1 'mpfr' number of precision 5000 bits
[1] 30414093201713378043612608166064768844377641568960512000000000000

何故か、oneを高精度に設定しておくと、正しい計算をしてくれた。

813:132人目の素数さん
20/01/26 16:33:21 G7gVG9Ku.net
RのroundのIEEE仕様

> round(2.5)
[1] 2
> round(1.5)
[1] 2

は丸め誤差が減るという説明だったので実験してみた。

# 四捨五入 vs IEEE with FUN(=mean) for x(=c(-0.9,-0.8,...,0.8,0.9))
comp <- function(n=10,FUN=mean,x=sample((-9:9)/10,n,rep=T),print=T){
X=FUN(x)
dif = abs(X-FUN(round(x))) - abs(X-FUN(f45(x))) # round後の実行と四捨五入後の実行の差
if(dif!=0 & print) cat(dif<0,' : ',sort(x),'\n') # 差があれば表示 round後が小さければTRUE
return(dif) # 差を返す dif<0:round優位 dif>0:四捨五入優位
}
comp()

k=1e5
# mean
re=replicate(k,comp(print=F))
c(IEEE=mean(re<0),四捨五入=mean(re>0),引き分け=mean(re==0))

# squared sum
comp(FUN=function(x) sum(x^2))
re=replicate(k,comp(FUN=function(x)sqrt(sum(x^2)),print=F))
c(IEEE=mean(re<0),四捨五入=mean(re>0),引き分け=mean(re==0))



> # 平均 mean
> re=replicate(k,comp(print=F))
> c(IEEE=mean(re<0),四捨五入=mean(re>0),引き分け=mean(re==0))
IEEE 四捨五入 引き分け
0.25235 0.16199 0.58566

> # 平方和 squared sum
> re=replicate(k,comp(FUN=function(x)sqrt(sum(x^2)),print=F))
> c(IEEE=mean(re<0),四捨五入=mean(re>0),引き分け=mean(re==0))
IEEE 四捨五入 引き分け
0.40519 0.01413 0.58068

平均だと小差だが、統計計算の内部処理で使う平方和だと大差がついたので、体感できた。

814:132人目の素数さん
20/02/08 17:42:30.00 +JttXwIS.net
"隔離中のクルーズ船では船内の換気が共通らしいから運悪く13日後に発症した奴がいるとその近くの部屋のやつは
プラスで14日隔離しないといけない。それが今の船内の状況という。
両隣のどちらかが感染したら14日延長、どの部屋も1日で感染する確率pは1%
部屋の配置は長方形でどの部屋にも両隣があるとする。
発症するか、隔離期間が終われば下船できる。
全員定員1の個室として客と乗務員を合わせた人数nは3000人。
クルーズ船から全員下船できる日数の期待値は?"

815:132人目の素数さん
20/02/08 17:42:46.53 +JttXwIS.net
rm(list=ls())
p=0.001 # 1日の感染確率
n=3000 # 収容者人数
d14=14 # 隔離日数
Q0=rep(d14,n) # 必要隔離日数の配列の初期値
#
ODA <- function(X){ # One Day After 必要隔離日数の配列 x から1日後の配列を返す
Q=X #


816:Xを作業用Qに代入 S=which(Q!=0)  # 未感染者susceptibleのindex s=length(S) # 未感染者人数 m=rbinom(1,s,p) # その日の感染数 if(m==0){ # 感染者0なら未感染者の Q[S]=Q[S]-1  # 必要隔離日数を1日減らして返す invisible(Q) }else{ I.idx=sample(S,m) # 未感染者Sからm人が感染、感染者のindex (Infected.idx) id2ext <- function(id){ # 感染者idからの両隣のidを返す plus =ifelse(id==n,1,id+1) # 最大番号なら1を返す,それ以外は1増やす minus=ifelse(id==1,n,id-1) # 1なら最大番号を返す,それ以外は1減らす unique(c(plus,minus)) # 重複を除く } E.idx=as.vector(sapply(I.idx,id2ext)) # 感染者の両隣のidを列挙し E.idx=unique(E.idx) # 重複を除く Extended quarantine.idx Q[E.idx]=d14 # 両隣は必要隔離日数をd14にリセット Q[I.idx]=0 # 感染者は必要隔離日数=0 (リセット者に重複していたら0で上書き) IE.idx=unique(c(I.idx,E.idx)) # 感染もしくは感染者の隣のindex minus1ifnotzero <- function(x) ifelse(x==0,0,x-1) # ゼロでなければ1を減じて返す Q[-IE.idx]=minus1ifnotzero(Q[-IE.idx]) # 感染もなく感染者の隣りでもない人の隔離日数を1日減らす invisible(Q) } } sim <- function(){ AZ=FALSE # All Zero 隔離日数がすべて0か? i=0 # カウンター Q=Q0 # 隔離日数配列初期値 while(!AZ){ # 隔離日数がすべて0になるまで Q=ODA(Q) # One Day After関数を実行 AZ=all(Q==0) # All zero? i=i+1 # カウンター } return(i) # 何日かかったかを返す } k=1e4 # k回のシミュレーションの RE=replicate(k,sim()) mean(RE) # 平均値=期待値



817:132人目の素数さん
20/02/08 18:25:56.61 Xaabj2Ml.net
感染確率0.1%やん
低すぎぃ

818:132人目の素数さん
20/02/08 19:50:08.59 +JttXwIS.net
>>780
一日の感染確率。
3000人いて1日3人くらい報告されたから0.1%/日くらいかな

819:132人目の素数さん
20/02/08 19:51:16.44 +JttXwIS.net
実行したら全員が下船できるまで約1ヶ月になった。
コードにまだバグがあるかも。

820:132人目の素数さん
20/02/09 21:31:53 IDQ3+Iu7.net
Rのcsvの文字化け治らねえ
csvそのものをutf-8にしたら今度は不正なマルチバイトがあるってエラー
どうすればいいか教えて

821:132人目の素数さん
20/02/09 22:07:23 vcjg+5qP.net
>>783
どんなデータ?
ヘッダーだけじゃなくてセル内も日本語?

822:132人目の素数さん
20/02/09 23:10:12 KodPd2ez.net
>>783
エスパーじゃないから、まず確認だけど

・Rを使ってる環境(OS)とRのバージョンは?
・CSVのコード変換に使ってるソフトは?
・CSVを読み込んでる関数と指定している引数は?

823:132人目の素数さん
20/03/06 19:53:26 WwE0ymvi.net
nCov2019 for studying COVID-19 coronavirus outbreak URLリンク(guangchuangyu.github.io)
後で遊んでみよう

824:132人目の素数さん
20/03/07 09:46:33.43 3M7vmA2q.net
>>786
エラーがでた。R 3.6.3にアップデートしたけど
> library('remotes')
> remotes::install_github("GuangchuangYu/nCov2019", dependencies = TRUE)
Downloading GitHub repo GuangchuangYu/nCov2019@master
Skipping 1 packages not available: BiocStyle
Installing 5 packages: downloader, cowplot, maps, magick, BiocStyle
Error: Failed to install 'nCov2019' from GitHub:
(converted from warning) package ‘BiocStyle’


825:is not available (for R version 3.6.3)



826:132人目の素数さん
20/03/07 11:22:48.00 tNSvsFaR.net
>>787
エラーと通り、BiocStyleパッケージがないので別途、bioconductorからインストールすればいい。
URLリンク(bioconductor.org)

827:132人目の素数さん
20/03/07 11:34:31.80 3M7vmA2q.net
>>788
ありがとうございます。

828:132人目の素数さん
20/03/07 11:38:15.72 3M7vmA2q.net
We also developed a web app (URLリンク(www.bcloud.org)) with interactive plots and simple time-series forecasts.
という記述があるんだけど  関数 nls による非線形回帰分析 で作成しているのかなぁ?

829:132人目の素数さん
20/03/09 20:05:18 0N1NTePA.net
面白い問題スレをRでシラミ潰しにカウントしてみた。

"縦n個、横n個のマス目のそれぞれに 1,2,3,...,n の数字を入れていく。
このマス目の横の並びを行といい、縦の並びを列という。
どの行にも、どの列にも、2つの対角線上にも同じ数字が1回しか現れない入れ方は何通りあるか求めよ。(2020京大文系 改)
n=4がオリジナル
"
library(gtools)
n=4
(a=permutations(n,n)) # nの順列
r=nrow(a)
f<-function(x){ # x=c(1,2,3,4) -> rbind(a[1],a[2],a[3],a[4])
ans=NULL
for(i in x){
ans=rbind(ans,a[i,])
}
return(ans)
}

b=permutations(r,n)
head(b) ; tail(b)
B=apply(b,1,f)
diag2 <- function(x){ # 行列xの右上から左下への対角線の配列を返す
n=nrow(x)
ans=numeric(n)
for(i in 1:n) ans[i]=x[i,n+1-i]
return(ans)
}
g <- function(v){ # matri(v,n)で列、対角線の要素がすべて異なればTRUEを返す
n=sqrt(length(v))
(x=matrix(v,n))
if(length(unique(diag (x))) < n) return(FALSE)
if(length(unique(diag2(x))) < n) return(FALSE)
flag=TRUE
for(i in 1:n){
if(length(unique(x[,i])) < n){
flag=FALSE
break
}
}
return(flag)
}
counter=NULL
for(i in 1:ncol(B)){
if(g(B[,i])) counter=append(counter,i)
}
length(counter)
counter
matrix(B[,counter[1]],n)
matrix(B[,counter[2]],n)
matrix(B[,counter[48]],n)

830:132人目の素数さん
20/03/10 07:11:26.36 H1fx2jVB.net
>>791
n=5 にするとメモリー不足でエラーがでた。
サンプリングでやってみる
# simulation
n=5
sim <- function(n=5){
v=as.vector(t(replicate(n,sample(n)))) # n × n行列要素をベクトル化
if(g(v,dia=TRUE)){ # diagonal latin squareなら
print(matrix(v,n)) # 行列化して表示
return(1)
}
return(0)
}
k=1e6
sum(replicate(k,sim(5)))

831:132人目の素数さん
20/03/10 12:07:20.32 KHQs8ybj.net
1億回モンテカルロしてようやく、1個みつかった。

[,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
[1,] 2 5 4 3 1
[2,] 4 3 1 2 5
[3,] 1 2 5 4 3
[4,] 5 4 3 1 2
[5,] 3 1 2 5 4

832:132人目の素数さん
20/03/11 11:06:12 7KW6Eui5.net
嫌ね最近は総当たりアルゴリズムで枝刈り使えば実用的な時間で解決できるこ知らない人が多くて

833:132人目の素数さん
20/03/15 08:45:11.95 OTl1KJku.net
versionが3.6,xになって、str2lang とか str2expressionという関数が追加されたんだな。
URLリンク(id.fnshr.info)
で知った

rep("1:6",5)
paste(rep("1:6",5),collapse=',')
str2lang(paste("expand.grid(",paste(rep("1:6",5),collapse=','),')'))
eval(str2lang(paste("expand.grid(",paste(rep("1:6",5),collapse=','),')')))
(s=rep("1:6",5))
(str=paste(s,collapse=','))
(lang=str2lang(paste("expand.grid(",str,')')))
eval(lang)

834:132人目の素数さん
20/03/21 17:23:30 RyI2Q/uv.net
The Clinical and Chest CT Features Associated with Severe and Critical COVID-19 Pneumonia

URLリンク(journals.lww.com)

の付表にこんなデータがあった

# Parameter Total (n=83) Severe/critica l Group (n=25) Ordinary Group (n=58) P Value
# Number of lobes Median (interquartile range, IQR)
# 5 (4-5) 5 (5-5) 5 (3-5) 0.003

重症群25例 中等症群58例でCTで肺炎像が確認できた肺葉数(1~5)が
全体で中央値が5 第一四分位数(少ない方から数えて25%の値)が4、第三四分位数(少ない方から数えて75%の値)が5
重症群では中央値5、第一四分位数5、第三四分位数5
中等症群では中央値5、第一四分位数3、第三四分位数5で
p値が0.003であるという。
0.0025~0.0035までとして、

この条件に見合う83例をリストアップすると
> re[100,][1:25]
[1] 1 4 4 4 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5
> re[100,][26:83]
[1] 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 3 3 3 3 3 3 3 4 4 4 4 4 4 4 4 4 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5
[48] 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5
という類の組み合わせで
19504通りと計算された。

重症群の肺葉数の平均は4.76
中等症群の平均は4.04
と計算された。

タイ値がこれだけ多いデータにWilcox検定を使う意味がわからんな。

835:132人目の素数さん
20/03/22 08:57:06 liILqu/N.net
# 感度0.7 特異度0.9のPCR検査で1000人中10人が陽性だったときの有病率の信頼区間をシミュレーションして計算するスクリプト

# アルゴリズムには自信がないw

sim <- function(n=1000,r=10,sen=0.7,spc=0.9,k=1e6,print=TRUE){
# n:検査件数 r:検査陽性数 sen=感度 spc=特異度 k:発生乱数の数,print:グラフ描画
prev=rbeta(k,1+r,1+n-r) # 有病率の事前分布を一様分布と仮定

PPV=prev*sen/( prev*sen + (1-prev)*(1-spc) ) # 検査特性を加味してPPV計算
prev.post = PPV*(1-spc)/(sen - PPV*(sen+spc-1)) # そのPPVから有病率を計算
# NPVでも同じ結果
# NPV=(1-prev)*spc/( (1-prev)*spc + prev*(1-sen)) # 検査特性を加味してNPV計算
 # prev.post = (1-NPV)*spc/(spc - NPV*(sen+spc-1)) # そのNPVから有病率を計算
mean=mean(prev.post) # 期待値
median=median(prev.post) # 中央値
mode=density(prev.post)$x[which.max(density(prev.post)$y)] # 最頻値
LU=unlist(HDInterval::hdi(prev.post))[1:2] # 95%信頼区間
re=c(mean=mean,median=median,mode=mode,LU) # 事後有病率の代表値
if(print){ # ヒストグラム描画
par(mfrow=c(2,2))
hist(prev,freq=F,xlim=c(0,1)) ; lines(density(prev),lwd=2)
hist(PPV,freq=F,xlim=c(0,1)) ; lines(density(PPV),lwd=2)
hist(prev.post,freq=F,xlim=c(0,1)) ; lines(density(prev.post),lwd=2)
BEST::plotPost(prev.post)
par(mfrow=c(1,1))
}
print(round(re,4)) # 概算値表示
invisible(list(re,prev.post)) # 代表値と事後有病率を非表示で返す
}
sim(100,1)
sim(1000,10)
sim(10000,100)
sim(100000,1000)

836:132人目の素数さん
20/03/22 14:13:54 liILqu/N.net
>>797(自己レス)
間違いに気づいたので撤回します。

837:132人目の素数さん
20/03/23 14:55:08 iIfIhG5+.net
MCMCで解決してみた。

【富山県最強伝説】新型


838:コロナウイルスPCR検査件数 54人 陽性0人 ある集団から54人を無作為に選んでPCR検査したら陽性0であった。 PCR検査の感度0.7 特異度0.9としてこの集団の有病率の期待値と95%信頼区間を推測せよ。 #---------------------------------------------------------------------------- # 感度SEN, 特異度SPCの検査でN人中X人が陽性であったときの推定有病率prevalence # 弱情報事前分布はprevalence ~ dunif(0,UL) , UL:上限 #---------------------------------------------------------------------------- PCRj <- function(N,X,UL=1,SEN=0.7,SPC=0.9,verbose=TRUE){ # UL:upper limit of dunif(0,UL) library(rjags) modelstring=paste0(' model { x ~ dbin(p,n) p <- prev*sen + (1-prev)*(1-spc) prev ~ dunif(0,',UL,') } ') if(verbose & UL!=1) cat(modelstring) writeLines(modelstring,'TEMPmodel.txt') dataList=list(n=N,x=X,sen=SEN,spc=SPC) jagsModel = jags.model( file="TEMPmodel.txt" ,data=dataList,quiet=TRUE) update(jagsModel) codaSamples = coda.samples( jagsModel , variable=c("prev","p"), n.iter=1e6, thin=10) js=as.matrix(codaSamples) BEST::plotPost(js[,'prev'],xlab='prevalence',showMode = TRUE) ; lines(density(js[,'prev']),col='skyblue') round(c(mean=mean(js[,'prev']),HDInterval::hdi(js[,'prev'])[1:2]),10) } PCRj(100,1) PCRj(1000,10) PCRj(10000,100) PCRj(100000,1000) PCRj(54,0) PCRj(54,0,UL=0.1)



839:132人目の素数さん
20/04/03 19:48:06 MNrUuJMd.net
a b c d e f g h i j
1 -0.0377710 0.02994835 0.1779426 0.29057472 0.13252796 0.3279709 -0.3534731 -0.54812874 -0.3869768 -0.1233967
2 0.2707033 0.09238235 -0.1042958 -0.08485129 -0.02590955 0.2159095 -0.3338677 0.00865952 -0.1575856 0.0953795

840:132人目の素数さん
20/04/03 19:50:07 MNrUuJMd.net
上のDFを

library(psych)
ICC(DF)

で級内相間求めようとすると変な値でるんだけどなんででしょう?

841:132人目の素数さん
20/04/03 22:01:48 1EdxzcOL.net
> DF
V1 V2
a -0.03777100 0.27070330
b 0.02994835 0.09238235
c 0.17794260 -0.10429580
d 0.29057472 -0.08485129
e 0.13252796 -0.02590955
f 0.32797090 0.21590950
g -0.35347310 -0.33386770
h -0.54812874 0.00865952
i -0.38697680 -0.15758560
j -0.12339670 0.09537950
> library(psych)
> ICC(x=DF,lmer=FALSE)
Call: ICC(x = DF, lmer = FALSE)

Intraclass correlation coefficients
type ICC F df1 df2 p lower bound upper bound
Single_raters_absolute ICC1 0.36 2.1 9 10 0.13 -0.18 0.74
Single_random_raters ICC2 0.34 2.0 9 9 0.17 -0.26 0.74
Single_fixed_raters ICC3 0.32 2.0 9 9 0.17 -0.24 0.72
Average_raters_absolute ICC1k 0.53 2.1 9 10 0.13 -0.43 0.85
Average_random_raters ICC2k 0.51 2.0 9 9 0.17 -0.69 0.85
Average_fixed_raters ICC3k 0.49 2.0 9 9 0.17 -0.63 0.84

Number of subjects = 10 Number of Judges = 2

842:132人目の素数さん
20/04/03 23:40:27 MNrUuJMd.net
>>802
すいません
書き方が良くなかったです。
subject が1,2
judge a,b,c,dをきちんとfirst,second,third,fourth
と書くべきでした。
subjectとjudgeはあってると思うのです。

843:132人目の素数さん
20/04/03 23:42:39 MNrUuJMd.net
例えば
first second third fourth
0 0.05 0.1 0.15
0 0 0.05 0.05
0.15 0.1 0.05 0.1
0 0.05 0.2 0.05
0.1 0.15 0.1 0.05
0.15 0.05 0.1 0.05

というデータで

Call: ICC(x = over_sight)

Intraclass correlation coefficients
type ICC F df1 df2 p lower bound upper bound
Single_raters_absolute ICC1 0.0068 1 5 18


844:0.43 -0.19 0.48 Single_random_raters ICC2 0.0068 1 5 15 0.44 -0.19 0.48 Single_fixed_raters ICC3 0.0068 1 5 15 0.44 -0.19 0.48 Average_raters_absolute ICC1k 0.0268 1 5 18 0.43 -1.70 0.79 Average_random_raters ICC2k 0.0268 1 5 15 0.44 -1.82 0.79 Average_fixed_raters ICC3k 0.0268 1 5 15 0.44 -1.82 0.79 Number of subjects = 6 Number of Judges = 4



845:132人目の素数さん
20/04/03 23:44:30 MNrUuJMd.net
となるのですが、ICC1が0.0068ってこんなに低くなるのでしょうか?
結果のとり得る値が1~0なので最大15%ぐらいの変動幅で、
制度としてはかなりいい検査方法だとおもったのですが・・・

846:132人目の素数さん
20/04/04 00:07:42 npCU99bV.net
少し理解できました。
範囲制約性の問題があるのですね。
今回のサンプルがみんな低い得点で分散が低いからICCが低く算出されていました。
ダミーデータ
1,1,1,1
を追加したらICC=0.99となりました。
得点の高いサンプルを追加しないとICCで信頼性は測れないのですね。

847:132人目の素数さん
20/04/04 00:09:17 npCU99bV.net
いま有病者と健常者の両方を計測する検査法で健常者のみのデータでICCを算出しようとしているのが間違いということですね。

上記のような場合で、健常者のみでも信頼性を算出する方法っていうのはないのでしょうか?

848:132人目の素数さん
20/04/04 21:44:33 ZFu90Xbq.net
>>806
DF=rbind(
c(0,0.05,0.1,0.15),
c(0,0,0.05,0.05),
c(0.15,0.1,0.05,0.1),
c(0,0.05,0.2,0.05),
c(0.1,0.15,0.1,0.05),
c(0.15,0.05,0.1,0.05),
c(0.0001,0.0001,0.0001,0.0001))

とダミーに0.0001を加えても
> DF2ICC1(DF)
ICC(1,1) ICC(1,k)
0.2462707 0.5665262

> psych::ICC(DF)
type ICC F df1 df2 p lower bound
Single_raters_absolute ICC1 0.25 2.3 6 21 0.072 -0.027
Single_random_raters ICC2 0.25 2.3 6 18 0.079 -0.028
Single_fixed_raters ICC3 0.25 2.3 6 18 0.079 -0.034
Average_raters_absolute ICC1k 0.57 2.3 6 21 0.072 -0.115
Average_random_raters ICC2k 0.57 2.3 6 18 0.079 -0.122
Average_fixed_raters ICC3k 0.57 2.3 6 18 0.079 -0.154

となるから、高値データでなくてもいいみたい。

849:132人目の素数さん
20/04/24 21:32:48 1Teq2ITX.net
R 4.0.0 来た

850:132人目の素数さん
20/04/25 06:37:54.89 R/UD6QQG.net
SIGNIFICANT USER-VISIBLE CHANGES
URLリンク(cran.r-project.org)

851:132人目の素数さん
20/04/25 07:20:54 R/UD6QQG.net
パッケージを一括インストール

install.packages(available.packages()[,1])

852:132人目の素数さん
20/04/25 07:29:33 R/UD6QQG.net
>>811
これやってからでないとパッケージのコンパイルができない。

After installation is complete, you need to perform one more step to be able to compile R packages:
you need to put the location of the Rtools make utilities (bash, make, etc) on the PATH.
The easiest way to do so is create a text file .Renviron in your Documents folder which contains the following line:

PATH="${RTOOLS40_HOME}\usr\bin;${PATH}"

You can do this with a text editor, or you can even do it from R like so:

writeLines('PATH="${RTOOLS40_HOME}\\usr\\bin;${PATH}"', con = "~/.Renviron")

853:132人目の素数さん
20/04/25 08:56:31 R/UD6QQG.net
>>811
libraryのフォルダで dir /B とやって既にinstall済のリストを作って
install.packages("rstan","ggplot2",....)とやった方がいいな。
5000ほどパッケージがあるらしいけど、全部インストールしたらどれくらいの容量が必要なんだろう?

854:132人目の素数さん
20/04/25 12:31:15 uVYqRSBX.net
やってみてくれw

855:132人目の素数さん
20/04/26 21:05:35 tZeixXMR.net
>>813 これでいいかな?
targetPackages <- available.packages()[,"Package"]
newPackages <- targetPackages[!(targetPackages %in% installe


856:d.packages()[,"Package"])] install.packages(newPackages, repos = "http://cran.r-project.org")



857:132人目の素数さん
20/04/26 22:22:15 tZeixXMR.net
高血圧で不安だという老人の経過観察入院1件。発熱してなくてほっとした。
ステーキハウスがテイクアウトを始めたからインセンティブはその足しにしようっと。

858:132人目の素数さん
20/05/03 15:15:43 ICXX0aJG.net
>>814
コンパイルなしでやってみた。

サイズ:19.6 GB (21,082,530,395 バイト)

ディスク上のサイズ:20.3 GB (21,805,858,816 バイト)

ファイル数: 527,982、フォルダー数: 118,521

859:132人目の素数さん
20/05/03 15:37:44 f6MQMkc5.net
Ubuntu 20.04でRcmdrがビルドできないんですけど、これはソフトウェアが20.04に対応するまで待つしかないですか?

860:132人目の素数さん
20/05/03 20:21:16 l1OdZntk.net
>>818
自己解決しました。ライブラリの不足でした。

861:132人目の素数さん
20/05/04 17:06:14.69 HJhKUMfp.net
4.0でまたsjis関連の問題が出まくりそう

862:132人目の素数さん
20/05/07 01:08:38 VnQvkZ57.net
4.0になってから
col=番号指定での色が目に優しくなったみたい。

hist(runif(100),col=2)
hist(runif(100),col=rgb(1,0,0,1))
hist(runif(100),col='red')

863:132人目の素数さん
20/05/07 18:12:52.58 nLAcI1eZ.net
rgbで256色でそんなに変化ないんじゃない。

864:132人目の素数さん
20/05/07 19:16:11 VnQvkZ57.net
>>822
colours() と入力すると 657色から選べるから256以上ありそう。

865:132人目の素数さん
20/05/07 23:34:33 8IDmAqjy.net
4.0からパレット変えたんじゃなかったか?

866:132人目の素数さん
20/05/07 23:39:55 8IDmAqjy.net
リリースノートより

The palette() function has a new default set of colours (which are less saturated and have better accessibility properties).
There are also some new built-in palettes, which are listed by the new palette.pals() function.
These include the old default palette under the name "R3". Finally, the new palette.colors() function allows a subset of colours to be selected from any of the built-in palettes.

867:132人目の素数さん
20/05/07 23:46:21 8IDmAqjy.net
具体的な変更点はこのあたりを参照方
URLリンク(developer.r-project.org)

868:132人目の素数さん
20/05/08 00:23:14.39 CfFk/Uw1.net
binomにある信頼区間をグラフ表示させてみた。
binom.ci <- function(x,n,cl=0.95){
PEci=binom::binom.confint(x,n,conf.level=cl)
y=nrow(PEci):1
oldpar <- par(no.readonly = TRUE)
on.exit(par(oldpar))
par(mar=c(3,3,2,2))
par(oma=c(0,4,0,0))
plot(PEci$upper,y,xlim=c(min(PEci$lower),max(PEci$upper)),type="n",
yaxt="n",ylab="",xlab="Confidence Interval",
main=paste("C.I. for", x,"out of",n))
points(PEci$upper,y,pch="|") ; points(PEci$lower,y,pch="|")
segments(PEci$lower,y,PEci$upper,y,lwd=3,
col=sample(colours(),1))
abline(v=PEci$mean[1],lty=3)
axis(2, at=y, labels=PEci$method,as.vector,las=2,cex=0.75)
PEci
}
binom.ci(3,312)

869:132人目の素数さん
20/05/08 00:48:23 CfFk/Uw1.net
>>826
情報、ありがとうございます。

?paletteのヘルプにあるスクリプトを実行すると体感できました。

#


870:# Demonstrate the colors 1:8 in different palettes using a custom matplot() sinplot <- function(main=NULL) { x <- outer( seq(-pi, pi, length.out = 50), seq(0, pi, length.out = 8), function(x, y) sin(x - y) ) matplot(x, type = "l", lwd = 4, lty = 1, col = 1:8, ylab = "", main=main) } sinplot("default palette") palette("R3"); sinplot("R3") palette("Okabe-Ito"); sinplot("Okabe-Ito") palette("Tableau") ; sinplot("Tableau") palette("default") # reset



871:132人目の素数さん
20/05/09 20:51:55 oDT7bFgO.net
rjagsのコードに

theta[i,j] <- min(1, exp(-alpha[i]*t[j]) + beta[i])といいれて、確率を1以下にして二項分布させてようとすると

Node inconsistent with parents というエラーがでた。 stackoverflow.comも明確な答が見いだせず、あれこれいじって

どうも確率1や0で二項分布する可能性があるとエラーがでるみたい、というのを発見。

1を0.99999とするとエラーが回避できた。

1を 1 - 1e-16としてもエラー回避できた。

872:132人目の素数さん
20/05/18 08:52:51.27 s/hrJxRo.net
mathematicaは内部どうなってんだか知らないが第何種ベッセル関数とか入ってくるめちゃくちゃ重い積分を計算してくれた

873:132人目の素数さん
20/05/25 12:44:17 3k8+9x6G.net
"
ある人物Dが新型コロナ肺炎に罹患したとする。
行動調査によって発症前にキャバクラに行っており
接客したキャバ嬢Cが人物D発症の2日後に発症していたことがわかった。
キャバ嬢Cは人物Dから移されたと主張して1億円の賠償を求めている。
潜伏期間には幅がありキャバ嬢Cから移された可能性もあると主張して
その確率を計算して賠償金を値切りたい。
いくら値切れるか計算せよ。
"
潜伏期間が従う分布はこれ
#--- incubation period ---
# from Li et al NEJM 2020
# lognormal mean = 5.2
ln_par1 = 1.434065
ln_par2 = 0.6612

Gt <- function(delay){
C=rlnorm(1e6,ln_par1,ln_par2)
D=rlnorm(1e6,ln_par1,ln_par2)
mean(C-D > delay)
}
Gt(2)

874:132人目の素数さん
20/05/25 12:48:45 3k8+9x6G.net
怖い本で紹介されていたパッケージ polspline は秀逸。
発生させた乱数から確率密度関数を作ってくれる。
複雑な分布だと収束できず作れないこともあるけど

対数正規分布の差の分布を乱数発生させてpdfが作れた。

library(polspline)
delay=2
ln_par1 = 1.434065
ln_par2 = 0.6612
c=rlnorm(1e5,ln_par1,ln_par2)
d=rlnorm(1e5,ln_par1,ln_par2)
hist(c-d, freq=F,col='white',breaks=100,ylim=c(0,0.11),
xlim=c(-30,30),ann=F,axes=F) ; axis(1)
fit=logspline(c-d)
curve(dlogspline(x,fit),-30,30,ann=F,bty='n',add=T)
segments(delay,0,delay,dlogspline(delay,fit),pch=19,col=4)
curve(dlogspline(x,fit),delay,30,add=T,type='h',col=4)
curve(plogspline(x,fit),-30,30,lty=3,bty='n')
1-plogspline(delay,fit)
fn <- function(delay) 1- plogspline(delay,fit)
curve(fn(x),0,14, bty='n' ,xlab='Delay', ylab='Probability')

875:132人目の素数さん
20/06/01 16:49:09 smFiMdov.net
今気づいたけどdplyr 1.0.0がcranに来てた

876:132人目の素数さん
20/07/25 08:42:04 1FL39oBq.net
Rのグラフの出力をGIF動画にしたかったので検索したら、このページが役立った。

URLリンク(cse.naro.affrc.go.jp)


877:ezawa/r-tips/r/36.html mytest <- function() { ANS <- readline("1+2? ") if (ANS == "3") cat("Correct!\n") else cat("Wrong...\n") } mytest() mymessage <- function() { Sys.sleep(3) cat("Hello.\n") } mymessage() 尚、GIF作製には  https://www.screentogif.com/ がお手軽だった。



878:132人目の素数さん
20/07/26 10:34:51 FqjSGBlb.net
他人のコードを読んでいたら、

'%&%' <- function(x,y) paste0(x,y)

という関数が定義されていた。

これは便利と思った。

> '√2 =' %&% sqrt(2) %&% ', π = ' %&% pi
[1] "√2 =1.4142135623731, π = 3.14159265358979"

879:132人目の素数さん
20/07/27 13:23:47 3h6isdRg.net
文字列をパイプでつないでいくのは面白いかも

880:132人目の素数さん
20/07/28 04:21:24 jhN+xo4C.net
'%.%' <- function(x,y) sum(x,y)
でベクトルの内積とかも

881:132人目の素数さん
20/07/28 04:22:11 jhN+xo4C.net
訂正
'%.%' <- function(x,y) sum(x*y)

882:132人目の素数さん
20/07/29 12:22:51 3HY+hEHZ.net
面白いけど使いどころが難しそう
%>%パイプとの親和性が無いのが痛い

883:132人目の素数さん
20/07/29 13:52:08 5tjjlndH.net
%文字%は二項演算子だから、定義次第じゃない?

884:132人目の素数さん
20/07/29 18:45:33 3HY+hEHZ.net
tidyverseや%>%を使わないならまあ

885:132人目の素数さん
20/07/30 18:02:20.97 8iPZt0Nw.net
>>835
それって意味があるの?
> paste0('√2 =', sqrt(2), ', π = ', pi)
[1] "√2 =1.4142135623731, π = 3.14159265358979"
普通にpaste0のまま使った方がタイプ量が圧倒的に少ないが。

886:132人目の素数さん
20/07/30 20:10:10 417El1m4.net
>>842
括弧の対応で混乱しそうなときにちょっと役にたつかも。

こんな感じ

eval(str2lang("expand.grid(" %&% paste0(rep("1:2",6),collapse=',') %&% ")"))

887:132人目の素数さん
20/07/31 07:51:08 0a0zx1wG.net
>>843
うーん、その例だとイマイチに思える

rerun(6, 1:2) %>% expand.grid
で済むものをわざわざ複雑にしているだけに感じる

888:132人目の素数さん
20/07/31 13:51:36.15 ImynyFWQ.net
>>844
無理やり、例示した感は否めないな。
標準装備でなら、
expand.grid(replicate(6,1:2,simplify = FALSE))
ですむし。

889:132人目の素数さん
20/07/31 23:36:09.03 0a0zx1wG.net
paste()やstr_c()以外を使うなら、sprintf()かglue::glue()が候補か
特にカンマが文字列に含まれるときにはpaste()より見やすくなるはず
sprintf("√2 = %s, π = %s", sqrt(2), pi)
glue("√2 = {sqrt(2)}, π = {pi}")

890:132人目の素数さん
20/08/01 18:51:48 2TFdzAyg.net
>>846
確かに便利ですね。
カンマを ','で入力するのは混乱のもとでしたから。
有用な情報、ありがとうございます。'

> glue::glue("√2 = {sqrt(2)}, sin(π/3) = {sin(pi/3)}")
√2 = 1.4142135623731, sin(π/3) = 0.866025403784439

891:132人目の素数さん
20/08/06 00:01:24 rivMs4GJ.net
初心者質問で申し訳ありません。
ある関数を作りたいのですが、その関数に入れる数値の数はランダムな場合はどのように書けばいいのでしょうか。
例えば、入れた要素をすべて掛け合わせる関数が作りたい場合、そこに入れる要素が(2,3,4)でも、(2,3,4,5,6)でも反応するような関数の


892:書き方を教えてくださると助かります。



893:132人目の素数さん
20/08/06 00:05:38 ID3ryEgK.net
ベクトルで渡せばいいのでは?
そういう話じゃない?

894:132人目の素数さん
20/08/06 01:18:04 rivMs4GJ.net
874さん。
847さん、回答ありがとうございます。
確かにベクトルで何かするのはわかるのですが、その部分がわからないのです。
出来れば下に問題を書くので、コードを書いていただけると非常に助かります。

問、正の整数であるベクトルを入力すると、そのベクトルの要素をすべて掛け合わせた値を結果として返す関数を作りなさい。

895:132人目の素数さん
20/08/06 02:03:47 V+bu3PeG.net
>>850
問題文これだけ?他に条件はないの?
標準の関数にあるけどいいのかな?

関数fを作るとして、一番いいのは標準の関数に余計な変更を加えないことだから、これが答えだけど…
f <- prod

896:132人目の素数さん
20/08/06 02:11:09 rivMs4GJ.net
849さん、返信ありがとうございます。

実は問2がありまして、たぶんそれは既存の関数にはないと思うので、そちらも教えていただけると非常に助かります。

問2、要素がすべて整数であるベクトルを入力すると、そのベクトルの要素の絶対値をすべて掛け合わせた値を結果として返す関数を作成せよ。

897:132人目の素数さん
20/08/06 05:13:12 03BiGX3I.net
>>852
f = function (x) abs(prod(x))

898:132人目の素数さん
20/08/06 05:15:08 03BiGX3I.net
>>851
while やfor もしくは再帰関数を使って作らせる問題かな?

899:132人目の素数さん
20/08/06 05:27:00.71 meNNWVIo.net
>>848
f <- function(...){
v=c(...)
ans=1
for(i in v) ans=ans*i
ans
}
> f(2,3,4)
[1] 24
> f(2,3,4,5,6)
[1] 720

900:132人目の素数さん
20/08/06 05:32:55.68 meNNWVIo.net
>>852
f <- function(...){
v=c(...)
ans=1
for(i in v) ans=ans*i
ans=ifelse(ans>0,ans,-ans)
ans
}
> f(-1,2,3)
[1] 6
> f(1 -2,-3,-4,-5)
[1] 60

901:132人目の素数さん
20/08/06 05:34:50.08 meNNWVIo.net
>>852
入力はベクトルだったから、
> f <- function(v){
+ ans=1
+ for(i in v) ans=ans*i
+ ans=ifelse(ans>0,ans,-ans)
+ ans
+ }
> f(c(-1,2,3))
[1] 6
> f(c(1 -2,-3,-4,-5))
[1] 60

902:132人目の素数さん
20/08/06 06:04:14.18 meNNWVIo.net
再帰だとこんな感じかな?
f <- function(...){
v=c(...)
n=length(v)
sub<-function(n){
if(n==0) return(1)
else v[n]*Recall(n-1)
}
sub(n)
}
> f(2,3,4)
[1] 24
> f(2,3,4,5,6)
[1] 720

903:132人目の素数さん
20/08/06 06:35:53 eFxPvNIl.net
みんなアタマいいなぁ…

904:132人目の素数さん
20/08/06 08:34:19 E/ufUouA.net
>>859
854, 855, 856を真似るなよ。

905:132人目の素数さん
20/08/06 08:49:09 E/ufUouA.net
再帰版はこんな感じかな。
rec.prod <- function(x) {
# 再帰により x の要素の絶対値の積を求める。
# 実際には prod(abs(x)) が良い。
l <- length(x) # ベクトルの要素数
if (l == 0) # 空のベクトルなら
return(1) # 積は1
x1.a <- abs(x[1])
if (l == 1)
x1.a
else
x1.a * rec.prod(x[-1])
}

906:132人目の素数さん
20/08/06 11:42:21 rivMs4GJ.net
質問者本人です。
皆様のお力添えのおかげで無事問題を解くことができました。
初心者質問にやさしく回答して頂いて感謝しかありません。

本当にありがとうございました。

907:132人目の素数さん
20/08/06 19:28:54.17 meNNWVIo.net
>>861
この方が>858みたいに関数の中で関数を定義とかなくてカッコいいと思ったのでsystem.timeで時間を比較しようと思って実験を始めたら、
何故か、rec.prodの方がoverflowしやすいなぁ。
頭からかけても尻からかけても同じじゃないかと思うんだが。
> prod(1:100)
[1] 9.332622e+157
> rec.prod <- function(x) {
+ # 再帰により x の要素の絶対値の積を求める。
+ # 実際には prod(abs(x)) が良い。
+ l <- length(x) # ベクトルの要素数
+ if (l == 0) # 空のベクトルなら
+ return(1) # 積は1
+ x1.a <- abs(x[1])
+ if (l == 1)
+ x1.a
+ else
+ x1.a * rec.prod(x[-1])
+ }
> rec.prod(1:100)
[1] NA
Warning message:
In x1.a * rec.prod(x[-1]) : NAs produced by integer overflow
> f <- function(...){
+ v=c(...)
+ n=length(v)
+ sub<-function(n){
+ if(n==0) return(1)
+ else v[n]*Recall(n-1)
+ }
+ sub(n)
+ }
> f(1:100)
[1] 9.332622e+157

908:132人目の素数さん
20/08/06 20:06:06 meNNWVIo.net
比較のために、関数名の�


909:キさを同じにして、時間のかかるRecallを関数名にしてsystem.timeで比較してみた。 > rm(list=ls()) > rp <- function(x) { + # 再帰により x の要素の絶対値の積を求める。 + # 実際には prod(abs(x)) が良い。 + l <- length(x) # ベクトルの要素数 + if (l == 0) # 空のベクトルなら + return(1) # 積は1 + x1.a <- abs(x[1]) + if (l == 1) + x1.a + else + x1.a * rp(x[-1]) + } > f1 <- function(...){ + v=c(...) + n=length(v) + sub<-function(n){ + if(n==0) return(1) + else v[n]*Recall(n-1) + } + sub(n) + } > f2 <- function(...){ + v=c(...) + n=length(v) + sub<-function(n){ + if(n==0) return(1) + else v[n]*sub(n-1) + } + sub(n) + } > system.time(replicate(1e5,prod(1:10))) user system elapsed 0.11 0.00 0.11 > system.time(replicate(1e5,rp(1:10))) user system elapsed 2.64 0.00 2.64 > system.time(replicate(1e5,f1(1:10))) user system elapsed 2.44 0.01 2.47 > system.time(replicate(1e5,f2(1:10))) user system elapsed 1.86 0.00 1.87



910:132人目の素数さん
20/08/06 20:31:17.99 E/ufUouA.net
それはね、856は厳密な意味での再帰ではないから速いしリ、ソースを食わないんだよ。ループを再帰風に書いただけだから。それよりもループのほうが速いに決まっている。
この問題を再帰で解くのはムダ以外の何ものでもない。

911:132人目の素数さん
20/08/06 20:33:25.51 w8yiRRv5.net
>>865
喩えれば、
親分が子分を再帰で酷使しているだけだから親分は消耗しない
という理解でいい?

912:132人目の素数さん
20/08/06 20:47:18.11 E/ufUouA.net
全然違う。
再帰は、複雑な問題をより小さい問題に分割することがキモだ。
856は元のベクトルはそのまま変わらずに存在していて、ある特定の要素を一つずつ処理しているからループとやってることは変わりない。
859は、一つ短いベクトルを自分自身に処理させているから真の再帰なのだ。

913:132人目の素数さん
20/08/06 22:25:29 meNNWVIo.net
>>867
f自身は再帰関数じゃないけど、呼び出しているsubは再帰関数では?

こういうのと同じ。
f <- function(x){ # 数列の和の階乗を返す
m=sum(x)
sub <- function(n){
if(n==1) return(1)
else{
return(n*Recall(n-1))
}
}
fact(m)
}

> f(c(1,2,3))
[1] 720

914:132人目の素数さん
20/08/06 22:50:49 XP8VEZbb.net
>>867
(ご入力訂正)
f自身は再帰関数じゃないけど、呼び出しているsubは再帰関数では?

こういうのと同じ。
f <- function(x){ # 数列の和の階乗を返す
m=sum(x)
sub <- function(n){
if(n==1) return(1)
else{
return(n*Recall(n-1))
}
}
sub(m)
}

> f(c(1,2,3))
[1] 720

915:132人目の素数さん
20/08/07 21:08:59 S7qsZ31k.net
856はsub()の引数がvでなくnなことと、nの入力に対して関数外のv[n]が帰ってくるのが、少し気になるかも
856が再帰っぽくないってのは、859はxを分割・再帰していってるのに対して、856はnを減じていってその都度vのn番目の値を参照してるところかな

それから、859がrec.prod(1:13)であっさりオーバーフローしてしまうのは、integer型だから
あと実行速度が少し遅いのは、xl.aへの代入操作と、if(l ==1){}の余分な条件分岐のせいだね

その辺を修正してやれば、こんな感じかな
# 再帰で問2
f <- function(x){
if(length(x) == 0) return(1)
abs(x[1]) * f(x[-1])
}

916:132人目の素数さん
20/08/08 05:40:19.06 2ggSSq05.net
>>870
勉強になりました。
ついでにwhile版を書いてみました。
f <- function(x){
ans=1
while(length(x)){
ans=ans*abs(x[1])
x=x[-1]
}
ans
}

917:132人目の素数さん
20/08/08 09:18:18 FvlAeRBY.net
>>870
859が遅い根本の原因は、x[-1] が生成されること。
他の指摘は、細かい高速化の工夫だから初心者に薦めるのはどうかと。
現に869で全く実用的に意味のないコードを書いているし。
題意を素直に表したほうがよいのでは?
絶対値の積は、積の絶対値と等しいから、absを呼ぶのは1回で済むが、何も説明無しにそうするのは私的にはアウトだ。メンテナンスの時に自分や他人が苦しむから。

918:132人目の素数さん
20/08/08 11:01:30 559rm1Tc.net
>>872
意味不明なこと言いだしてるが大丈夫か、落ち着け
859は、無駄な条件分岐あるし、すぐオーバーフローするし、コードが冗長だしで、それこそ初心者以外にもNGだぞ

絶対値の積うんぬんに関しては、859と同じでabsを毎回呼んでる、余計な代入操作が無いだけだ
落ち着いてコードを見ろ

速度うんぬんの話はこれまで話題に出てきたように、856と比べての話だ、話についてこれないなら無理に入ってこなくていい
別に高速化を目的としてるわけじゃなく、859から冗長な部分やオーバーフローの原因を取り除いた結果高速化されたってだけだ

だが、速度が遅い原因がxl.aへの代入でなく、x[-1]作成が原因てのはそのとおりだ
文章を書いてる途中で、オーバーフローの原因(代入操作はこっちだ)と勘違いしてしまったようだ
これは訂正に感謝だ

919:132人目の素数さん
20/08/08 11:24:32 FvlAeRBY.net
>>873
おまえこそもちつけ。
再帰は、再帰の停止条件と、自分自身が行う作業に分離できる。
この場合の停止条件は、要素が1つになったときと考えるのが自然だろう。
数学的には要素が0でもよいし、Rの場合はそれでうまくいくから問題はない。だが、そういった詳細を何も説明せずにこれでよい、と示すのはどうかな?
あと、絶対値を取ったのを代入しているのは、この作業が複雑になった場合の修正の確実さを優先するためで、優秀なバイトコンパイラであれば速度の差はなくなる。

920:132人目の素数さん
20/08/08 23:06:27.95 UlZ+DmHh.net
一人だけエラー吐いて、まともに動かない関数書いた無能が、
それでも、恥ずかしげもなく、一生懸命マウント取ろうとあがく姿は、
滑稽で哀れになってくるわ

921:132人目の素数さん
20/08/13 17:34:36 5b54QocS.net
>859がrec.prod(1:13)であっさりオーバーフローしてしまうのは、integer型だから
の意味が理解できなくて、実験してみた。

> rec.prod <- function(x) {
+ l <- length(x)
+ if (l == 0)
+ return(1)
+ x1.a <- abs(x[1])
+ if (l == 1)
+ x1.a
+ else
+ x1.a * rec.prod(x[-1])
+ }
>
>
> rec.prod(1:13)
[1] NA
Warning message:
In x1.a * rec.prod(x[-1]) : NAs produced by integer overflow
> rec.prod(as.numeric(1:13))
[1] 6227020800
> rec.prod(c(1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13))
[1] 6227020800
> rec.prod(c(1L,2L,3L,4L,5L,6L,7L,8L,9L,10L,11L,12L,13L))
[1] NA
Warning message:
In x1.a * rec.prod(x[-1]) : NAs produced by integer overflow

integer型のデータだとオーバーフローしちゃうけど、as.numericでdouble型にするとエラーがでない。

一方、

> f <- function(x){
+ if(length(x) == 0) return(1)
+ abs(x[1]) * f(x[-1])
+ }
> f(1:13)
[1] 6227020800
> f(as.numeric(1:13))
[1] 6227020800
> f(c(1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13))
[1] 6227020800
> f(c(1L,2L,3L,4L,5L,6L,7L,8L,9L,10L,11L,12L,13L))
[1] 6227020800
>

とエラーがでないなぁ。

何故だろう?

922:132人目の素数さん
20/08/20 13:26:56 mPUCNi08.net
Package ‘XXX’ was installed before R 4.0.0: please re-install it
とメッセージがでてXXXをインストールすると次は

Package ‘YYY’ was installed before R 4.0.0: please re-install it
とでてきてうんざりしていた。

stackoverflow.comで以下の答をみつけて解決した。

.libPaths()
update.packages(ask=FALSE, checkBuilt=TRUE)

923:132人目の素数さん
20/09/09 22:54:07 IR7822fG.net
ありがとうございます

924:132人目の素数さん
20/10/19 07:15:12.45 21zikI9w.net
PならばQ をパイプで P %=>% Q として論理演算で遊んでみた。
"
問題 : 「シリツ医 ならば (馬鹿 ならば 裏口 である)」という命題と同値な命題はどれか?
1 : シリツ医 ならば (裏口 ならば 馬鹿 である)
2 : 馬鹿 ならば (シリツ医 ならば 裏口 である)
3 : 馬鹿 ならば (裏口 ならば シリツ医 である)
4 : 裏口 ならば (シリツ医 ならば 馬鹿 である)
5 : 裏口 ならば (馬鹿 ならば シリツ医 である)
"
# PならばQ ≡ (P かつ (Qでない))ではない
'%=>%' = function(P,Q) !(P & !Q)
# premise
A = function(S,


925:B,U) S %=>% (B %=>% U) # choice B1 = function(S,B,U) S %=>% (U %=>% B) B2 = function(S,B,U) B %=>% (S %=>% U) B3 = function(S,B,U) B %=>% (U %=>% S) B4 = function(S,B,U) U %=>% (S %=>% B) B5 = function(S,B,U) U %=>% (B %=>% S) # premise => choice C1 = function(S,B,U) A(S,B,U) %=>% B1(S,B,U) C2 = function(S,B,U) A(S,B,U) %=>% B2(S,B,U) C3 = function(S,B,U) A(S,B,U) %=>% B3(S,B,U) C4 = function(S,B,U) A(S,B,U) %=>% B4 (S,B,U) C5 = function(S,B,U) A(S,B,U) %=>% B5 (S,B,U) # combination grid of TRUE & FALSE gr=expand.grid(c(T,F),c(T,F),c(T,F)) # test for premise => choice all(mapply(C1,gr[,1],gr[,2],gr[,3])) all(mapply(C2,gr[,1],gr[,2],gr[,3])) all(mapply(C3,gr[,1],gr[,2],gr[,3])) all(mapply(C4,gr[,1],gr[,2],gr[,3])) all(mapply(C5,gr[,1],gr[,2],gr[,3]))



926:132人目の素数さん
20/10/19 07:15:28.30 21zikI9w.net
# choice -> premise
D1 = function(S,B,U) B1(S,B,U) %=>% A(S,B,U)
D2 = function(S,B,U) B2(S,B,U) %=>% A(S,B,U)
D3 = function(S,B,U) B3(S,B,U) %=>% A(S,B,U)
D4 = function(S,B,U) B4(S,B,U) %=>% A(S,B,U)
D5 = function(S,B,U) B5(S,B,U) %=>% A(S,B,U)
# test for choice -> premise
all(mapply(D1,gr[,1],gr[,2],gr[,3]))
all(mapply(D2,gr[,1],gr[,2],gr[,3]))
all(mapply(D3,gr[,1],gr[,2],gr[,3]))
all(mapply(D4,gr[,1],gr[,2],gr[,3]))
all(mapply(D5,gr[,1],gr[,2],gr[,3]))

927:132人目の素数さん
20/11/17 19:55:57.27 UJMPy762.net
,で文字列を分けようとしたらうまくいかなかったがHELPをみたら解説してあった。
> #.で文字列を分ける
> unlist(strsplit('3.14','.'))
[1] "" "" "" ""
> unlist(strsplit('3.14','\.')
Error: '\.' is an unrecognized escape in character string starting "'\."
>
> unlist(strsplit('3.14','[.]'))
[1] "3" "14"
> unlist(strsplit('3.14','.',fixed=TRUE))
[1] "3" "14"

928:132人目の素数さん
20/11/17 20:18:32.66 /TSutyYc.net
unlist(strsplit("3.14", "¥¥."))
人に見てもらいたかったら読みやすく書けよ。アンタのプログラムはいつも読みにくい。

929:132人目の素数さん
20/11/18 01:42:18.74 CJUGi+QQ.net
>>882
備忘録として書いたのでレスがつくとは思ってなかったが、レスthanx.

930:132人目の素数さん
20/12/10 02:17:40.15 Whv7aYu3.net
数値積分をさせていたら
初めてみるこんなエラーが返ってきた。
roundoff error is detected in the extrapolation table
困ったときのstackoverflow.comで
URLリンク(stackoverflow.com)
As for the integration problem, package cubature generally does a better job when integrate
と解決法が記載されていた
integrate(fn, lower, upper)$value
でエラーが返ってきたが、
cubintegrate(fn, lower,upper, method='pcubature')$integral
とするとエラーなしに計算してくれた。
(備忘録)

931:132人目の素数さん
20/12/12 23:25:15.53 DvLXeu4z.net
それエラーが出るべきなのに出ない誤りなんじゃ、って可能性はないの?

932:132人目の素数さん
20/12/13 08:12:33.91 xmsEH+j9.net
>>885
別スレの問題を「プログラムで面積を数値計算させていたらエラー発生
体験したければ読みにいコードの下記をどうぞ。
r= 0.66017210648907 ; s=2.89088405538017
# 面積計算にintegrate で エラー
sub <- function(c,Area1=1){ # c 円Cの中心のx座標
b0=(c^2+r^2-s^2)/(2*c) # B(b0,b1) # 円Cと円Oの交点Bの座標
b1=sqrt(r^2-(c^2+r^2-s^2)^2/(4*c^2))
blue = function(x) sqrt(s^2-(x-c)^2) # 円Cの方程式
BLUE= integrate(blue,b0,c+s)$value*2 # 青の面積
green = function(x) sqrt(r^2-x^2) # 円Oの方程式
GRE


933:EN=integrate(green,-r,b0)$value*2 # 緑の面積 GREEN+BLUE-Area1 # GREEN+BLUE=1 } sub=Vectorize(sub) x=seq(-r-s,r-s,length=100) ; plot(x,sub(x),pch=19) ; abline(h=0,lty=3) # 面積計算にcubintegrate でエラーなし library(cubature) sub <- function(c,Area1=1){ # c 円Cの中心のx座標 b0=(c^2+r^2-s^2)/(2*c) # B(b0,b1) # 円Cと円Oの交点Bの座標 b1=sqrt(r^2-(c^2+r^2-s^2)^2/(4*c^2)) blue = function(x) sqrt(s^2-(x-c)^2) # 円Cの方程式 BLUE= cubintegrate(blue,b0,c+s,method="pcubature")$integral*2 # 青の面積 green = function(x) sqrt(r^2-x^2) # 円Oの方程式 GREEN=cubintegrate(green,-r,b0,method='pcubature')$integral*2 # 緑の面積 GREEN+BLUE-Area1 # GREEN+BLUE=1 } sub=Vectorize(sub) x=seq(-r-s,r-s,length=100) ; plot(x,sub(x),pch=19) ; abline(h=0,lty=3)



934:132人目の素数さん
20/12/13 08:15:08.06 xmsEH+j9.net
入力の省力化にこんな関数を道具箱に詰めた
# 定積分
integral <- function(fn,lwr,upr,...){
cubature::cubintegrate(fn,lwr,upr,method='pcubature',...)$integral
}

935:132人目の素数さん
20/12/13 09:32:37.11 xmsEH+j9.net
>>886
library(MASS)にareaという面積計算の関数があるのを思い出したのでやってみた。
library(MASS)
r= 0.66017210648907 ; s=2.89088405538017
# 面積計算にMASS::area
sub <- function(c,Area1=1){ # c 円Cの中心のx座標
b0=(c^2+r^2-s^2)/(2*c) # B(b0,b1) # 円Cと円Oの交点Bの座標
b1=sqrt(r^2-(c^2+r^2-s^2)^2/(4*c^2))
blue = function(x) sqrt(s^2-(x-c)^2) # 円Cの方程式
BLUE=area(blue,b0,c+s)*2 # 青の面積
green = function(x) sqrt(r^2-x^2) # 円Oの方程式
GREEN=area(green,-r,b0)*2 # 緑の面積
GREEN+BLUE-Area1 # GREEN+BLUE=1
}
sub=Vectorize(sub)
x=seq(-r-s,r-s,length=100) ; plot(x,sub(x),pch=19) ; abline(h=0,lty=3)
こっちはエラーがでない。

936:132人目の素数さん
20/12/21 20:43:26.34 gcvC1Sv7.net
func <- function (...) {
return(anova(...))
}
func(fit1, fit2, fit3)
オブジェクトの引数をうけとって、関数内の関数anovaに渡して
ちゃんと動かすにはどうしたらいいですか?

937:132人目の素数さん
20/12/23 07:21:19.77 N7Fbsys3.net
>>889
>775みたいに
c(...)もしくはlist(...)で引き出すのでは動作しない?

938:132人目の素数さん
20/12/23 11:45:33.99 DPeLDm1M.net
>>889
> mydata <- data.frame(x = runif(10), y = runif(10), z = runif(10))
> xy <- lm(y ~ x, data = mydata)
> zy <- lm(y ~ z, data = mydata)
> func <- function (...) {
return(anova(...))
}
> func(xy, zy)
Analysis of Variance Table
Model 1: y ~ x
Model 2: y ~ z
Res.Df RSS Df Sum of Sq F Pr(>F)
1 8 0.40535
2 8 0.39312 0 0.012234
ちゃんと動くけど。
何がどう問題なのかを明確にして質問しないと助言を得られないよ。

939:132人目の素数さん
21/01/03 22:00:14.73 8tLYm46h.net
やっぱり、パッケージになっている関数は高速だな。
1万までの素数を求める
> rm(list=ls())
> primes <- function(n) (1:n)[-outer(2:n,2:n)][-1]
> system.time(primes(10000))
user system elapsed
0.60 1.92 2.88
> rm(list=ls())
> library(numbers)
> system.time(Primes(10000))
user system elapsed
0.00 0.00 0.03

940:132人目の素数さん
21/01/21 00:00:54.88 KZXQ/VTY.net
時刻と、その時に従業員がいた場所(住所)がデータとして一覧化されていて、
いつ、どこによくいるかをクラスタリングしたいのですがRは出来るのでしょうか?

941:132人目の素数さん
21/01/24 12:08:49.15 oqt0Qph1.net
>>893
SpaTimeClusパッケージ

942:132人目の素数さん
21/02/14 11:56:55.00 g9kE6hlo.net
IPB size
1 I 82571
2 B 4909
3 B 230
4 B 231
こんな感じのデータフレームを複数ファイルを読み込んで
ファイル別に横につなげる場合どのようにfor文を書けばいいですか?

943:132人目の素数さん
21/02/14 12:28:29.31 n5qxzAHa.net
purrrパッケージを使った方が速いんじゃね?

944:132人目の素数さん
21/02/14 16:02:48.85 g9kE6hlo.net
> 894
ありがとう。これで無事横並べられた
URLリンク(gist.github.com)

945:132人目の素数さん
21/03/16 13:05:28.85 cJpJJpsg.net
# 振幅1の正弦波の一周期の長さを求めよ
の計算に、一般化して計算できるように関数を書いてみたのだが、
文字列での入力が必要でどうも美しくない。
# 関数y=f(x)の曲線でx=from からx=toまでの長さを求める
CurveLength <- function(f='sin(x)',from=-pi,to=pi){
str=paste("deriv(~ ",f,",","'x',func=TRUE)")
Df <- eval(str2lang(str))
f1 <- function(x) as.numeric(attributes(Df(x)))
f1=Vectorize(f1)
integrate(function(x) sqrt(1+f1(x)^2), from, to, rel.tol = 1e-12)
}
計算としてはあっていると思う。
> CurveLength()
7.640396 with absolute error < 2.6e-13
> CurveLength('log(1+cos(x))',0,pi/2)
1.762747 with absolute error < 2e-14
もっとエレガントなコードがあればご教示をお願いします。

946:132人目の素数さん
21/03/18 08:46:13.56 IPPbuENC.net
時系列データ成型の解説でいいサイトないですか

947:132人目の素数さん
21/03/31 01:41:06.70 Cwg7NuDW.net
>>898
コードのことならプログラム板のほうで訊いたほうがよさそう

948:132人目の素数さん
21/06/05 21:13:05.02 5b0TiKZo.net
R version 4.1.0 (2021-05-18) -- "Camp Pontanezen" になってパイプに標準で対応したのは嬉しい。
function(x) が \(x)と略記可能になった。
ちょっと練習
f <- \(x) sample(100,x,rep=TRUE)
f(50) |> sort() |> unique() |> length()
> f <- \(x) sample(100,x,rep=TRUE)
> f(50) |> sort() |> unique() |> length()
[1] 40
詳細は
URLリンク(cran.r-project.org)


949:132人目の素数さん
21/06/06 12:41:44.43 X+DUyz8T.net
Vectorize()もパイプで受けてくれた。
(\(n) sample(10,n, replace = TRUE) |> unique() |> sort()) |> Vectorize() -> f.new
f.new(1:5)
f.old <- Vectorize(function(n){
sort(unique(sample(10,n,replace = TRUE)))})
f.old(1:5)

950:132人目の素数さん
21/06/06 12:54:15.47 X+DUyz8T.net
|> curve()は描画されなかった。
(\(x) sqrt(1-x^2)) |> Vectorize() |> curve()
> (\(x) sqrt(1-x^2)) |> Vectorize()) |> curve()
Error: unexpected ')' in "(\(x) sqrt(1-x^2)) |> Vectorize())"

(\(x) sqrt(1-x^2)) |> Vectorize() -> fn
curve(fn)
1/4円を描画

951:132人目の素数さん
21/06/06 22:14:15.22 X+DUyz8T.net
パイプで速度が落ちるかと思ったけど変わらないね。
> (\(x) sample(1000,x,replace=TRUE) |> sort() |> unique() |> length()) -> f.new
> system.time(replicate(1e5,f.new(5000)))
user system elapsed
28.66 0.01 28.70
> f.old <- function(x) length(unique(sort(sample(1000,x,replace=TRUE))))
> system.time(replicate(1e5,f.old(5000)))
user system elapsed
28.65 0.00 28.67

952:132人目の素数さん
21/06/06 22:37:59.70 jjPG368x.net
そのパイプを使ったコードをquote関数に噛ませば分かるけど実際はパーサーが下のコードに変換してるだけらしい。
なので実態としては演算子や関数ではないのでオーバーヘッドが生じないとのこと。

953:132人目の素数さん
21/06/08 05:41:54.05 uSV089kB.net
>>905
レスありがとうございます。早速、やってみました。
> quote((\(n) sample(10,n, replace = TRUE) |> unique() |> sort()) |> Vectorize())
Vectorize((function(n) sort(unique(sample(10, n, replace = TRUE)))))

954:132人目の素数さん
21/06/08 06:02:44.83 uSV089kB.net
dplyrのパイプ%>%だと他に引数がないときは関数の()は省略できるけど
今回、搭載された|>は()がないとエラーになるな。
> library(dplyr)
> sample(10,10,replace=TRUE) %>% sort
[1] 1 2 4 5 6 7 7 7 7 8
> sample(10,10,replace=TRUE) %>% sort(decreasing = TRUE)
[1] 9 9 7 6 5 5 3 1 1 1
> sample(10,10,replace=TRUE) |> sort
Error: The pipe operator requires a function call as RHS
> sample(10,10,replace=TRUE) |> sort()
[1] 3 4 5 5 6 6 8 8 8 10
> sample(10,10,replace=TRUE) |> sort(decreasing = TRUE)
[1] 10 10 9 8 7 7 6 6 5 2

955:132人目の素数さん
21/06/08 06:10:22.55 uSV089kB.net
パイプで送る関数に引数が1個なら自分でパイプを定義するのと変わらないなぁ。
オンラインで実行できるサイトだと必ずしも最新版のRに対応していないし、外部ライブラリ非対応のところもあるので
自分でパイプを定義の方がいいかも
'%|%' <- function(x,FUN) FUN(x)
> sample(10,10,replace=TRUE) %|% sort %|% unique
[1] 1 3 5 6 7

956:132人目の素数さん
21/08/29 23:23:03.95 OFN46wh5.net
# 備忘録
hogehoge <- function(x){
cat(deparse(substitute(x)),'=',x,'\n')
}
ch='Swiss'
hogehoge(ch)
> hogehoge(ch)
ch = Swiss

957:132人目の素数さん
21/11/05 22:47:20.72 lTyg7nhh.net
これ↓、思ったように動かないけど、普通?
iris[any(iris[,3]==c(6.1,5.1)) ,]
いまいちR言語の仕様がわからん。

958:132人目の素数さん
21/11/05 23:38:14.16 I43ryX9p.net
何をしたいのか説明できない理系脳かな?
適当に推測するに、
iris[iris[, 3] %in% c(6.1, 5.1), ]

959:132人目の素数さん
21/11/06 21:41:29.28 8hjJFETA.net
ありがとう。
雰囲気で伝わるかなと思った。

960:132人目の素数さん
21/11/06 21:45:56.76 8hjJFETA.net
SQL(例えばAccess)とRの、データ分析に関する違いって何だと思う?
Rの有利な点は表を容易に分割→編集→結合できる点で、Accessの有利な点はクエリを何段にも重ねることで表を視覚的に扱えることだと思うんだけど、どうかな?
要約すると、細かいとこに手が届くのと、そうではないけど直感的なところ。

961:132人目の素数さん
21/11/06 21:53:39.63 8hjJFETA.net
SQLがAccessの例に限定されちゃってるね。
でも同じように文字で書くなら、Rの方が便利に思えるな。
Officeが使える環境でR使ってるから、Rだけの環境に移行すればどんな不便が発生するか検討中なんだけど、どう思う?

962:132人目の素数さん
21/11/08 19:14:28.35 xqrS4yV9.net
>>913
> SQL(例えばAccess)とRの、データ分析に関する違いって何だと思う?
何を言っているのか分からないが、用意されいている分析手法の豊富さが全く違うだろ。
例えば、多重検定の検定法とかSQLにあるの?ノンパラメトリックの多重検定とかちゃんとできるの?

963:132人目の素数さん
21/11/08 19:14:46.14 xqrS4yV9.net
>>913
> SQL(例えばAccess)とRの、データ分析に関する違いって何だと思う?
何を言っているのか分からないが、用意されいている分析手法の豊富さが全く違うだろ。
例えば、多重検定の検定法とかSQLにあるの?ノンパラメトリックの多重検定とかちゃんとできるの?

964:132人目の素数さん
21/11/09 20:40:06.49 hGmtIAbe.net
そうだよね。
組み合わせて使うもんだよね。SQLとRは。
ただ、境界線をどこで引くべきか微妙なところで悩む。RだとRStudioのレポートとして残せるから、分析手順を残していくことを考えると極力R使った方がいいのかな。

965:132人目の素数さん
21/12/04 13:16:48.05 3GLpEIlX.net
いや、SQLとRは全くの別物だろ
SQLはデータベースのマネジメントシステムで、
Rはデータ分析のツールじゃん

966:132人目の素数さん
21/12/04 14:11:32.93 0kKQqVbM.net
別物だから組み合わせて使う意味がある

967:132人目の素数さん
21/12/04 20:41:11.61 fCvhwSlW.net
いや、SQLとRは全くの別物だろ
組み合わせて使う意味はない

968:132人目の素数さん
21/12/04 22:13:49.92 6B5EP1qJ.net
そうだな、お前は使わなくていい
絶対に使うな

969:132人目の素数さん
21/12/04 22:16:19.95 sikGs8rn.net
別物だから別々に使う意味がある

970:132人目の素数さん
22/02/28 07:22:18.49 A7JZ2ass.net
URLリンク(twitter.com)
を実行出来た方いますか?
(deleted an unsolicited ad)

971:sage
22/02/28 12:38:08.27 dt49D0nX.net
URLリンク(detail.chiebukuro.yahoo.co.jp)
で解決しました。
スレを汚してすみませんせした。

972:132人目の素数さん
22/03/02 03:27:08.75 RV9q7yNr.net
今更レスだけどなんでaccessと比べるのか、ex


973:celじゃねーの excelは商用だけあって機能的には検定回帰成分分析因子分析何でもできてRに劣るところは無いし、統計以外なら最適化が強い Rより遅いしVBAは醜いし、365なんていきなり環境ぶっ壊されかねないからRに安住するけど



974:132人目の素数さん
22/03/02 03:30:48.43 RV9q7yNr.net
インタラクティブに使う分にはCSE使えるexcelの方が便利だな
ぜひともRに取り入れたい機能の一つ

975:132人目の素数さん
22/03/02 03:42:31.09 RV9q7yNr.net
excelで巨大データ扱うにはaccessインテグレーション機能で補完し合うといいとは聞くけど、俺のアカデミック割のofficeではaccessはハブられてた悲しみ

976:132人目の素数さん
22/03/06 16:53:40.50 BGFbnw+F.net
精度が怪しいだけ

977:132人目の素数さん
22/03/06 16:55:06.71 BGFbnw+F.net
コマンドで操作しづらい

978:132人目の素数さん
22/03/18 15:05:36.24 Z+B2NJF6.net
contourのzlimはどう設定すればよいのでしょうか?
URLリンク(navaclass.com)
ユークリッド距離のzlimは
contour(x,y,z.E,zlim=c(0,3),nlevels = 5,add=T)
のようにzlim=c(0,3)に設定されているのですが、
マハラノビス距離のzlimは
contour(x,y,z.D,zlim=c(0,1),nlevels = 5,labels="", add=T)
のようにzlim=c(0,1)に設定されています。
確かに、ユークリッド距離のほうは(1, 1)の点が1.0の等高線上にありますし、
マハラノビス距離のほうもAは0.75、Bは2.2という距離に相応しいところに点があります。
ただ、zlim=c(0,3)の意味はきっと0から3までの範囲に限るという意味なんでしょうが、
z.Eとの値も見ても3で区切られているようには見えません。
実験してみましたが、z.Eのほうのzlimは3.5、z.Dのほうのzlimは1.4で等高線が変化するようです。
これでは新たな相関係数を使ったときにどう設定すればよいのか分かりません。
どうか教えて下さい。

979:132人目の素数さん
22/03/18 15:25:12.51 3f0eXSLb.net
>>930
xlim, ylimは指定した値でスパッと切るわけではないので(前後に余裕を持たせるようになっている)、
zlimも同じ仕様だと想像するよ。
xlimやylimで指定した特定の値でスパッと切るオプションがあったと思うので、
zlimにも有効でないかどうか、そこから調べて見れば?

980:132人目の素数さん
22/03/18 17:48:09.58 Z+B2NJF6.net
>>931
ありがとうございます。
今、いろいろ計算した結果、等高線の位置自体は正しいことが判りました。
ただ、問題は等高線の刻みがzlimと相関係数の組み合わせによって変わることです。
具体的には、等高線が0.5刻みになったり1.0刻みになったり0.25刻みになったりします。
にもかかわらずnlevelsは5本のままなので、全体が膨らんだり縮んだり、見た目が全然違ってくるんですよね。
その度に手でzlimの値を1とか3とか5に変えてあげないといけません…これらの数字はまったく理解できません。
なので質問を変えさせていただいて、
相関係数が0以外の時でも等高線上に0.5, 1.0, 1.5, ...などのラベルを強制的に表示する方法は無いでしょうか?
相関係数が0(つまりユークリッド距離)の時は等高線上にそれらの数値が表示されます。
それが相関係数が0.1にでもなった途端に表示されなくなります
(数値表示用に輪が途切れた形でブランクは空いているようなのですが)。
等高線上に0.5, 1.0, 1.5, ...などのラベルが表示されるようになれば、上記の問題も許容できると思います。
余談ですが、
>スパッと切るオプション
調べてみると、xaxs="i"のことのようですね。
"r"だとグラフの端に4%の余白があったのが"i"だと無くなりました。

981:132人目の素数さん
22/03/18 18:10:24.04 Z+B2NJF6.net
すみません、labels=“”になっているというオチでした。
とりあえず、これで問題ないか確認します。

982:132人目の素数さん
22/03/21 13:18:24.75 k7XqFrKG.net
ご助力をいただきたく、質問いたします。
対象データ
データフレームA内のB列, <chr>型 中身は例として 文字列で"2022/02/24"が入っている。
やりたいこと
この文字列をRのDate型に変換したい
やってみたこと。
tidyverseを用いて
A %>% select(B) %>% as.Date()
これだとエラーが出ました。
エラー文は「'.'からクラス"Date"へ変換はできません」
どうやったらこのB列をRのDate型に変換できますでしょうか。

983:132人目の素数さん
22/03/21 15:20:29.09 SKGsv+wa.net
>>934
パイプ処理したいならlubridateパッケージが便利です。チートシート(英語)が公開されているので、使い方は確認してみてください。
パッケージ名のスペル間違ってたらごめん。

984:132人目の素数さん
22/03/21 17:46:23.39 qn67+d1x.net
>>934
変換できない理由は、dplyr::select()関数の返り値がdata.frame型で
as.Date()関数の引数がベクトル型でなければならないからです。
なので、
as.Date(A$B)
とすれば、Date型でベクトルな返り値を得ることができます。tidyverseを
使いたい(というかパイプで処理したい)なら
A %>%
.$B %>% # ベクトルとして取り出す
as.Date()
となります。
返り値をdata.frame型で得たい場合は、dplyr::mutate()関数を使って
A %>%
dplyr::select(B) %>%
dplyr::mutate(B = as.Date(B))
とします。
tidyverseは、基本的にデータフレームを入力としデータフレームを出力と
しますので、列をベクトルとして処理したい場合はmutate()関数を使う必要が
あります。

985:132人目の素数さん
22/03/21 20:28:10.47 k7XqFrKG.net
>935様
>936様
ご教示ありがとうございます。
参考にまずは試してみます。

986:132人目の素数さん
22/03/22 07:49:54.09 kcYWMWlK.net
>>934
selectじゃなくてpullにすれば動くよ

987:132人目の素数さん
22/03/22 12:12:27.45 CNKDZNvw.net
pull()は知らなかったけど引数を二つ指定するとnamed vectorも作れるんだな。

988:132人目の素数さん
22/03/25 19:24:11.66 YaAd0nW/.net
借金を返す手段は大増か
踏み倒し(=ハイパーインフレ)の2者選択。
今、日本はお金をどんどん刷って紙幣価値を下げ、
後者の道をまっしぐら。
「税金で借金を返せる難易度ランキング」
1位 日本     257%
2位 スーダン   210%
3位 ギリシャ   207%
4位 エリトリア  175%
5位 カーボベルデ 161%
6位 イタリア   155%
7位 スリナム   141%
://twitter.com/fujimaki_takesi/status/1505469787174227973?s=20&t=3LeCpoO4fcZVopj2x8b9Dw
         日本から始まる世界的株式市場の大暴落
それが最終的な暴落であることがはっきりするや否や、
マ仆レーヤは出現するでしょう。
マ仆レーヤが公に世界に現れるにつれて、
UFOがとてつもない数で姿を表すでしょう
(deleted an unsolicited ad)


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