14/09/28 15:51:40.13 .net
>>454
RNAでの塩基配列の(標準配列に対する)差異はRNAでは直接には「多型」
の確認がされてないので厳密にはSNPとは言わない。DNAの塩基配列の
SNP部分がRNAの塩基配列に転写されたものだ。
NGSのトランスクリプトーム・データ上では
「SNP detection」という。CLC bio Japanのホームページ資料では
「SNP検出」となっている。
URLリンク(www.clcbio.co.jp)
尚、NGSによるトランスクリプトーム解析ではmRNAに限定されず広く
RNA全体のデータの解析がされるので、mRNA」にこだわらないのが普通で
「SNP detection in RNA」または「SNP detection in RNA-seq data」
というみたいだ。