STAP細胞の懐疑点 PART711at LIFE
STAP細胞の懐疑点 PART711 - 暇つぶし2ch480:浅見真規 ◆Xy1SDuGQ6I
14/09/28 15:51:40.13 .net
>>454
RNAでの塩基配列の(標準配列に対する)差異はRNAでは直接には「多型」
の確認がされてないので厳密にはSNPとは言わない。DNAの塩基配列の
SNP部分がRNAの塩基配列に転写されたものだ。

NGSのトランスクリプトーム・データ上では
「SNP detection」という。CLC bio Japanのホームページ資料では
「SNP検出」となっている。
URLリンク(www.clcbio.co.jp)

尚、NGSによるトランスクリプトーム解析ではmRNAに限定されず広く
RNA全体のデータの解析がされるので、mRNA」にこだわらないのが普通で
「SNP detection in RNA」または「SNP detection in RNA-seq data」
というみたいだ。


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