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2004年、長嶋一茂が生放送[10]で現役時代にステロイドを使用していたことを告白。
2005年、週刊朝日が千葉ロッテマリーンズの選手10名近くがグリーニーを使用していると報道[11]（球団は一貫して否定）。
2007年、野村貴仁が週刊ポスト上で2週にわたって自らの薬物使用とともに2000年の読売ジャイアンツ内で
一部の選手にグリーニーが使用されていたことを暴露[12]。
2009年、愛甲猛が自らの著書で中日ドラゴンズ時代にステロイドを使用していたことを告白[13]。
2000年代前半、清原和博や松坂大輔が疲労回復のためにニンニク注射を受けていることが、
ドーピング問題とは異なる文脈でたびたび採り上げられた[14]。この点について、注射の成分にかかわらず、
世界アンチ・ドーピング機関（WADA）は正当な治療目的以外の静脈注射を禁じている。
2005年、3年前までNPBに所属しておりメジャーリーグ傘下に所属中の養父鉄がドーピング検査で陽性を示して
メジャーリーグ機構から制裁を受けた（15試合の出場停止）。
2007年、前年までNPBに所属しておりメジャーリーグ傘下に所属中の入来祐作がドーピング検査で陽性を示して
メジャーリーグ機構から制裁を受けた（50試合の出場停止）。
2007年、メジャーリーグでの筋肉増強剤使用の実態調査をしたミッチェル報告書が公開されたところ、
アレックス・カブレラやジェフ・ウィリアムスら日本プロ野球に所属中および所属していた選手11人の名前もあったが、
当時のNPBのコミッショナーである根來泰周はNPBの薬物対策に問題はないとし、報告書とは無関係の立場を取った[15]。
その他、2008年の夕刊フジの記事において、「不振のカブレラ＆松中、消えぬ“疑惑”」というタイトルで、
「『日本でも2年前からドーピング検査が厳しくなっ たから…』との憶測が流れる」[16]という内容が書かれた。
ドーピング検査の回数はMLBと比べると少ない。
MLBでは2009年の1年間で3722人の検査を実施したが[23]、
NPBでは2007年から約5シーズンで543人（年平均約109人）の検査にとどまっている[24]。